由于Autodock Vina的结果是生成了一个一个的独立文件,我们完成对接后往往需要一个一个的查看,还有将里面的数据提出整理成表格进行排序和筛选。
我之前的文章介绍了一对多和多对多的对接方法。由于结果保存的路径不太一样,所以我们以这两个结果为例,分别介绍一下代码。
一、一对多对接结果的批处理代码
一对多的结果储存在以其配体命名的文件夹中,如下图所示。
三、excel的读取
上述两个代码均可生成一个的文件。然后将这个文件的后缀名由改成。这样就可以被excel识别并读取,并可进行排序筛选等一系类的操作,并可以另存为的格式储存了。结果如下图所示。

有一个小伙伴推荐了一个叫sailvina的软件,是一个大神写的图形化vina操作程序,功能很齐全,比较简单操作,无需搞这么多代码。大家可以下载使用试试。
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