实操讲解基于利用ImageJ软件进行WB条带灰度分析及数据处理

当我们处理细胞之后,想看一下该处理对细胞中某一基因表达的影响,我们需要从蛋白水平来看一下该基因表达的蛋白的量的变化,那我们通常会做westernblot,对蛋白进行半定量,通过对westernblot结果的分析,我们可以知道该处理对基因的表达造成了什么影响。

1 、打开Image J 软件。

2 、导入WB 条带图片:File Open →找到WB 条带。

3 、把图片转化成灰度图片:Image Type 8-bit

4 、消除图片背景的影响:Process Subtract Background ,在弹出的对话框中,填上50 基本就可以了,并勾上Lightbackground ,点击OK 。此时图片背景会变白一些。

5 、设置定量参数:Analyze Set Measurements 。在弹出的对话框中勾选Area Mean grayvalue Min& max gray value Integrated density

6 、设置单位:Analyze Set Scale 。在弹出的对话框“Unit of length ”后面填上“pixels ”,其他的不用改动。

7、 WB 图片转换成亮带:Edit Invert

8 、选择菜单栏下的不规则圆形工具,将圆圈手动拉倒第一条带,并尽量将条带都圈起来。

9 、点击菜单栏Analyze 下拉出现的measurement ,即可弹出你选定区域的灰度统计值。也可以点击快捷键(英文状态下的键盘m )。

10 、手动移动不规则圆圈至下一条条带,重复8 9 步骤,直至所有条带都被测量。

11 、当测定完所有条带,选结果中的“Edit ”的“Select All ”,然后复制数据“IntDen ”到Excel 表即可进行分析。也可以直接在Results 对话框中,选择File Saveas ,直接导出excel 表格。

12 、在excel 表格中将目的蛋白的灰度值除以内参蛋白的灰度值,进行归一化处理。

13、GraphpadPrism软件中作柱状图。

经过灰度统计分析后得到的结果更准确更有说服力,是不是感觉上升了一个档次呢?

__________________________________

声明:本站部分文章及图片源自用户投稿,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!

上一篇 2020年2月17日
下一篇 2020年2月17日

相关推荐