这里，我们用正常的GWAS分析，考虑所有的协变量（数值协变量+因子协变量）+ PCA协变量，然后用混合线性模型进行分析。
1. 协变量文件
c.txt文件
- 第一列为截距
- 第二列为性别
- 第三列和第四列为世代
- 第五列，第六列，第七列为PCA的结果
2. 表型数据
p.txt文件
3. plink二进制文件
4. GEMMA的LMM模型GWAS分析
生成G矩阵
进行GWAS分析
日志：
结果文件：
Beta结果比较：
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