安装分子对接软件rDock

安装分子对接软件rDock

1. rDock简介

安装分子对接软件rDock
rDock是一种快速且通用的开源对接程序,可用于小分子-蛋白和小分子-核酸对接,能够进行高通量虚拟筛选(HTVS)和结合模式预测的研究。
rDock主要用C ++编写,其他的脚本和程序用C ++、perl或python语言编写。完整的rDock软件包需要少于50 MB的硬盘空间,并且可以在所有Linux计算机中编译。

2. rDock下载

rDock下载链接:download

3. rDock安装

3.1 依赖程序

在安装rDock前确认以下程序已安装

  • gcc GNU C compiler (or your preferred C compiler)
  • g++ GNU C++ compiler (or your preferred C++ compiler)
  • make
  • popt Command-line argument processing (run-time)
  • popt-devel Command-line argument processing (compile-time)
  • cppunit C++ unit testing framework (port of JUnit)
  • cppunit-devel C++ unit testing framework (port of JUnit)

我自己的环境是缺少cppunit,单独下载安装,并将头文件复制到rDock的安装目录下的。

3.2 BUILD

进入安装目录

接下来运行,根据自己的环境选择

这一步总 错没有找到文件,该文件在路径下,于是将cpp的include文件复制到build路径下。

3.3 测试

如果测试运行成功,则表示rDock安装成功。

3.4 设置环境变量

将以下变量写入~/.bashrc中来运行rDock。

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