python绘制基因结构图_手把手教你从头绘制基因簇结构图

能够绘制基因簇结构图的工具有不少,例如在线工具 Gene Structure Dispaly Server(主要用于绘制基因结构图、基因簇结构图),或者本地工具SnapGene viewer(专业的质粒图谱绘制软件,也可绘制基因簇结构图)。今天小编再给大家提供一个曲线救国的方案:生成 svg 代码——图片调整。以下是基因簇结构图的示意图,可以根据需要添加标注或注释信息。

(1)第一列为基因名或者基因编 ;

(2)第二列为基因方向,使用 + 和 – 表示;

(3)第三列为基因起始位置;

(4)第四列为基因终止位置。

4生成 svg 代码

准备好数据文件以后我们就可以生成 svg 代码了,所使用的脚本为get_SVG_code_for_gene_map.py。

(1)该脚本的帮助文档如下

(3)输入

python get_SVG_code_for_gene_map.py -i test.txt -o test.code.svg 生成 svg 代码。

需要注意的是,脚本、输入及输出需要给定绝对路径。

至此,基因簇结构图完成绘制,您学会了么p>文章知识点与官方知识档案匹配,可进一步学习相关知识Python入门技能树首页概览212210 人正在系统学习中 相关资源:Yalefree雅乐简谱打谱软件_打谱软件-WindowsServer工具类资源…

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