miRDB:软件预测的哺乳动物miRNA靶基因数据库

”生信修炼手册”!

miRDB通过MirTarget这个软件预测了人，小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息，并将其整理成了数据库， 址如下

http://www.mirdb.org/

该数据库中涵盖的物种如下

1. huaman

2. mouse

3. rat

4. dog

5. chicken

每个物种相关的miRNA和靶基因数量统计如下

点击红色链接可以查看详细信息和相关的pubmed文献。
官 提供了两种检索功能

1. target search

该功能一次只可以检索一个miRNA后者gene, 检索框如下所示

检索结果如下所示

miRDB本质上是一个软件预测的miRNA靶基因数据库，如果只看这一个数据库，结果的假阳性率会比较高，最好的做法是结合多个软件预测或者数据库的结果，类似数据库的思路，来弥补单一软件算法的不足之处。

·end·

—如果喜欢，快分享给你的朋友们吧—

扫描关注微信 ，更多精彩内容等着你！

文章知识点与官方知识档案匹配，可进一步学习相关知识MySQL入门技能树数据库组成表32115 人正在系统学习中