有了试验数据,我们就需要进行数据的处理与分析,而在试验设计中,通常分为单因素试验或者双因素试验。试验中要考察的指标称为试验指标,影响试验指标的条件称为因素,因素所处的状态称为水平,若试验中只有一个因素改变则称为单因素试验,若有两个因素改变则称为双因素试验,若有多个因素改变则称为多因素试验。方差分析就是对试验数据进行分析,检验方差相等的多个正态总体均值是否相等,进而判断各因素对试验指标的影响是否显著,根据影响试验指标条件的个数可以区分为单因素方差分析、双因素方差分析和多因素方差分析。
在进行数据分析之前,我们要对试验数据进行检验,即独立性检验、正态性检验、方差齐性检验,若三者检验符合条件,则我们可以进行参数分析,如果不符合条件则只能进行非参数分析。
(参数分析:假定数据服从某分布(一般为正态分布),通过样本参数的估计量(x±s)对总体参数(μ)进行检验,比如t检验、方差分析、Pearson的相关分析等。非参数分析:不需要假定总体分布形式,直接对数据的分布进行检验。由于不涉及总体分布的参数,故名「非参数」检验,包括卡方检验、二项分布检验、K-S检验、秩和检验、符 检验、Spearman和Kendall的相关性分析等)
接下来,我演示一个R语言进行的参数分析的单因素方差分析。
原始数据:探究添加不同浓度的氮肥(N1,N2,N3,N4,N5)对植物根际土壤硝态氮的浓度影响
(同学们使用edit()函数,把我的数据仿照输入,这样你们的数据不需要整理,直接进入数据重构的那步。)
第一步:进行数据整理与重构:
发现数据错误,进行数据的调整(见上一文章)
数据重构:
第二步:对数据进行参数检验(独立性、正态性和方差齐性检验)
可以看到三大参数检验P>0.05,即接受原假设,数据满足独立性,正态性和方差齐性。
第三步:单因素方差分析和多重比较
单因素方差分析
P
多重比较:介绍两种函数LSD.test()和Duncan.test()
可以看到不同组别之间的显著性差异。
第四步:提取关键数据并处理(以Duncan多重比较为例)
第五步:根据结果画图
end~
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