生物信息学软件_15项生物信息学软件著作,都有哪些工具让你来用?

医药加平台(上海遐永医药科技)最近拿到了下面15项软件著作,如果您对其中的某项感兴趣,欢迎您联系我们一起深度合作,联系方式见文末。

   如您看了某篇最新发表的高分文章的创新思路与漂亮图表,让你心里很痒痒,想模仿这篇文章的生信分析的套路, 如何来学呢p> 宋伟老师简介

个人成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训方向:《测序与芯片数据分析》、《TCGA/GEO数据库挖掘分析》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》、《ceRNA 络构建分析》等。

医药加平台推出生信高级分析服务 (由医药加生信班专家讲师-宋伟博士团队提供服务)

强强联合

      生物信息是一种综合性的学科,也是一门工具。它与临床医学、动植物学、微生物学等方向有这密切的联系,通过生信分析可以——获得理论或基础的结论、指导实验方向和丰富文章内容。

我们需要“强强联合”,把各自擅长的领域联合——研究方向领域基础+生信高级分析。个性的分析服务,可以节省时间、提高质量。

高级分析特点:不同项目方向做高级生信分析,设计不同的创新思路,达到课题研究目的,获得结果(图表)及结论。

定制化数据分析内容展示:

类别

分析项目

分析内容

单组学高通量高级分析

(基于已有的标准分析结果,添加高级分析)

转录组学:lncRNA、miRNA、mRNA、circRNA测序/芯片数据。

基因组学:全基因组测序、外显子测序/芯片数据。

表观组学:DNA或RNA甲基化测序/芯片数据。

蛋白组学:ITRAQ质谱数据。

代谢组学:GC-MS,LC-MS,NMR

宏基因组学:16s测序、宏全基因组测序数据。

差异表达基因筛选;

无监督聚类的PCA或HeatMap分析;

有监督聚类的OPLS-DA分析;

基因上下游调控预测(miRNA,TF);

VENN图分析;

蛋白与蛋白互作 络分析;

WGCNA模块分析;

基因相关性分析;

lncRNA(circRNA)与mRNA共表达分析及 络构建;

关键lncRNA(circRNA)或miRNA功能分析;

竞争内源RNA(ceRNA)预测;

多组样本不同时间(浓度)递增数据分析;

筛选关键基因(lncRNA、circRNA或mRNA);

GSEA富集分析;

生存预后分析;

基于公共数据库的高级分析。

基于TCGA/GEO/SRA/EBI数据库做癌症靶标预测(miRNA, lncRNA, mRNA)和通路功能筛选。

多套数据整合分析.

多组学整合分析(基于标准分析结果,添加高级分析)

全转录组整合分析;

转录组与蛋白组整合分析;

蛋白组与代谢组整合分析;

基因组与转录组整合分析;

表观组与转录组整合分析;

个性化定制分析(想法帮你实现)

根据需求做图、做表;

基于参考文献思路进行生信分析;

基于客户制定的分析思路进行生信分析。

中药/单体 络药理学分析

中草药单体成分分析及有效成分预测

药物单体靶标蛋白预测及功能分析

药物功能 络药理学分析

结果图例展示:

示例图 GSEA富集分析

示例图 非编码RNA的功能富集分析(pathway)

示例图 基因在疾病中的生存预后分析(KM曲线)

示例图 时间(浓度)递增序列数据分析

【科研培训】

【医药加】RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计研讨会(8月22-23日) 2020年8月22-23日【医药加】循证医学Meta分析及 状Meta分析(8月22-23日) 2020年8月22-23日【医药加】R语言数据分析实战技术( 络)研讨会(8月29-30日) 2020年8月29-30日 【医药加】生命医学课题设计与高质量SCI写作研讨会(9月12-13) 2020年9月12-13日【医药加】临床预测模型构建与统计分析进阶研讨会(9月12-13日) 2020年9月12-13日【医药加】单细胞测序数据分析与课题设计研讨会(9月12-13) 2020年9月12-13日【医药加】调控性非编码RNA与外泌体研究策略( 络)研讨会(9月19-20日) 2020年9月19-20日【医药加】中药 络药理学的研究策略与实用技能研讨会(9月26-27日) 2020年9月26-27日【医药加】多组学数据整合挖掘与分析( 络)研讨会(9月25-27日) 2020年9月25-27日【医药加】Cell级别高级科研作图研讨会(9月26-27日) 2020年9月26-27日【医药加】膜片钳与光遗传及钙成像技术研讨会(10月6-8日) 2020年10月6-8日

这12个生物信息学视频免费学习 2020-08-12【干货分享】32个常用生信分析工具,建议收藏 2020-08-08单细胞文章快讯,筛选了10篇 2020-08-08Meta分析视频课程,从初级到高级,共300多节课!【限时领取】 2020-08-07硬核科研视频–Endnote实用技巧最强攻略 2020-08-05 络图节点属性修改Cytoscape实操教学 2020-08-05这个软件不需要代码也可以做出漂亮的热图【培训视频分享】 2020-08-04博后小姐姐视频:教你科学数据分析及可视化处理 2020-08-03医药加—Cytoscape软件安装教学视频 2020-08-03使用Excel做火山图视频教学–医药加 2020-08-03高质量的课题如何设计以渔!从生信+基础+临床研究实操培训开始! 2020-08-02相关资源:智慧渔业水产养殖信息化服务管理平台整体建设方案.doc_智能水产…

声明:本站部分文章及图片源自用户投稿,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!

上一篇 2020年11月13日
下一篇 2020年11月13日

相关推荐