前言
“一图顶千言”这句话在耳边经常听到，一张好的信息图表可以使我们想要传递的信息更加清晰、有逻辑的呈现在别人的眼前。我认为优秀的生物信息学家要能够制作优秀的信息图，帮助科研人员传达思路，换个思路来想，这种能力值得每一个人去锻炼，去提高。今天想要跟大家分享的是一个非常有用的可视化软件，很多时候，事物的关系并不是直来直去，而是 状的，Cytoscape这款软件就是帮助我们将这种 状关系呈现出来的利器！
Cytoscape 简介
Cytoscape是一个开源软件平台，用于分子相互作用 络和生物学代谢途径的可视化，并将这些 络进行注释，基因表达谱和其他数据进行整合。 虽然Cytoscape最初是为生物学研究设计的，但现在它是复杂 络分析和可视化的通用平台。 Cytoscape核心组件为数据集成，分析和可视化提供了一套基本功能。 其他功能可用作应用程序（以前称为插件）。任何人都可以基于Cytoscape开放API开发任何应用程序。个人觉得这个软件优点有以下几点：
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开源。尽管很多时候大家弄不清开源和免费的关系，但你明白开源对于个人的使用来讲等同于免费，当然，在此基础之上如果你可以设计出自己的一套东西就更加有价值了。
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图表专业。在很多国际的刊物中会发现由该软件制作的 状图和代谢通路关系图，以及土壤中关于菌群关系的一些图表。PS：记得自己配上合适的颜色哦！
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跨平台。该软件可以在不同的系统中使用，对于不熟悉linux系统的广大小伙伴们来说是一个非常大的优势。可以在windows下画出种种精美的图表，想想都觉得很酷。
接下来的一段时间我将详细的介绍该软件的具体用法，希望你也能学会利用这款工具。感谢你看完今天的文章，和你一起成长为更好的自己!
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