铜死亡基因在骨关节炎免疫浸润中的生物信息学分析

摘要：

文题释义：

铜死亡：是近期新发现的一种细胞程序性死亡，主要依赖于线粒体呼吸，铜与三羧酸循环的脂化组分直接结合，促使脂酰化蛋白聚集和铁-硫簇蛋白丢失，蛋白质脂化导致蛋白毒性应激，最终致使细胞死亡。

生物信息学：是指整合计算机科学、生物学和信息技术，以此分析复杂生物数据的一门学科。

背景：免疫浸润在骨关节炎的病程发展过程中发挥着重要作用，而铜死亡是近期最新发现的一种新型细胞程序性死亡，目前尚未有铜死亡基因调控免疫浸润在骨关节炎中的相关机制研究。

目的：整合铜死亡基因和GEO数据库相关芯片，分析铜死亡基因与免疫浸润之间的关联性，构建风险模型，并进行基因本体、京都基因与基因组百科全书富集分析以及miRNA、中药预测，为今后骨关节炎免疫浸润方面的铜死亡机制挖掘提供理论支持。

方法：通过GEO数据库检索符合条件的骨关节炎相关芯片，对其进行标准化处理；基于处理后的基因表达矩阵进行免疫浸润提取和量化，分析免疫浸润细胞及功能之间的相关性，以及它们在骨关节炎组和对照组中的差异性；整合处理后的铜死亡基因表达矩阵和标准化处理后的芯片基因表达矩阵，筛选出与骨关节炎相关的铜死亡基因，并构建风险模型，分析骨关节炎铜死亡相关基因的风险概率，另外通过FunRich软件预测其上游miRNA；最后通过Enrichr 站和Coremine Medical数据库对骨关节炎铜死亡相关基因进行基因本体、京都基因与基因组百科全书富集分析及中药预测。

https://orcid.org/0000-0003-0841-0496(王伟伟)；https://orcid.org/0000-0002-0595-6154(欧志学)

中国组织工程研究杂志出版内容重点：组织构建；骨细胞；软骨细胞；细胞培养；成纤维细胞；血管内皮细胞；骨质疏松；组织工程

关键词: 铜死亡, 骨关节炎, 免疫浸润, 生物信息学, GEO数据库, 单样本基因集富集分析, PDHB, miRNA

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铜死亡基因在骨关节炎免疫浸润中的生物信息学分析