NGSCheckMate：数据配对检查好工具
求知若渴 没有BUG
背景
生信小灶
肿瘤NGS或者其它类似数据分析工作，大的前提就是样本使用的正确性，然而很多意外的情况都会导致样本的错误使用，对它们进行质控显得尤其重要。
原理
软件处理fasq、bam、vcf等格式，获得VAF的信息，通过计算VAF的相关性，来判断样本是否来自同一个样本。
02
fastq模式
输入文件
运行命令
04
软件评价
优缺点
软件比较好装，也容易配置和使用，结果易于解读。但是它只能检测出两个样本是否匹配，但是样本之间是否有相互的污染，则不能够进行质控，对于肿瘤的检测，这个方面的信息仍是需要留意的。
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于
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