liunx操作入门
命令格式:命令+选项+文件
command [-optons [parameter]] [FILE]
ssh
ssh 用户名@ip地址
ssh xiongxiangyi@10.225.3.1
free -g 查看电脑内存使用状况
sleep暂停系统几秒
后加&放到后台
echo 输出命令
mkdir创建文件夹
cd 移动目录
cd ~ 回到自己的目录
cat 查看文档
cat >
快速输入脚本
cat -n 文件|grep 匹配内容 与grep -n 效果一样
软件安装
基础安装
1、先搜索安装软件下载地址
samtools安装
下载好包
解压j
tar xvfj samtool-1.10.tar.bz2
x—-解压的意思
v—–弹出选项告诉你解压了啥
fj 文件类型
直接使用程序bowtie2相当于快捷方式
关于任务后台运行调到前台运
Shell支持作用控制，有以下命令实现前后台切换：
- command& 让进程在后台运行
- jobs 查看后台运行的进程
- fg %n 让后台运行的进程n到前台来
- bg %n 让进程n到后台去
- kill %n 杀死job PS:”n”为jobs命令查看到的job编 ，不是进程编 .
fg、bg、jobs、&、ctrl + z都是跟系统任务有关的，虽然现在基本上不怎么需要用到这些命令，但学会了也是很实用的.
###可以通过对命令的组合调用后台将前台命令终止到后台然后后台启动运行
通过使用命令对集群的上自己的任务进行操作
nohup
qsub 提交任务
qstat -u username（这是你的用户名）
qdel -j id (删除服务器上的对应id的任务)
从集群下载文件的方法:
除了xshell中的xftp以后的命令方法
sz
scp
__移动到下载目录查看__文件已经下载过来了
脚本
一般格式，通过脚本来实现批量操作数据，或者运行流程
捕获
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