引文分析软件histcite简介

      这是《文献管理与信息分分析》课程内容的一部分。

        有人说，在WOS里按照引用次数排序，引用次数最多的必定参加价值更大,其实不然，后面会有解释。

        我所知的文献信息分析软件有基于引文的分析软件histcite，基于内容分析的refviz、omniviz、Tda等，还有分析研究前沿的citespace等。

这里先简要介绍一下引文分析软件histcite它的功能和用法。

        histcite＝history of cite，意味引文历史，或者叫引文图谱分析软件。该软件系sci的发明人加菲尔德开发，能够用图示的方式展示某一领域不同文献之间的关系。可以快速帮助我们绘制出一个领域的发展历史，定位出该领域的重要文献，以及最新的重要文献。

软件的最新试用版本可以从www.histcite.com 站下载到。

        软件的试用非常简单，但如何从软件给出的图谱中得出有价值的信息，以及不同图谱展示的内在含义，需要我们不断揣摩和理解。

下面先介绍一下如何使用软件；然后介绍一下软件里涉及的一些概念；最后给出几个个示例。

4、数据导入后，软件会自动进行分析。初学者可以不去追究各种按钮的含义。在tool菜单下，选择graph maker，然后在新的界面点击左上角的make graph 按钮。软件会根据默认的条件作出一张引文关系图来，来展示当前数据库中重要文献之间的关联。

5、读图  作出图之后，理解图谱才是关键。一般默认会画出30篇文献之间的关联。图上有30个圆圈，每个圆圈表示一片文献，中间有个数字，是这篇文献在数据库中的需要。圆圈的大小表示引用次数的多少，圆圈越大表示受关注越多。不同圆圈之间有箭头相连，箭头表示文献之间的引用关系。多数情况下，你会看到最上面有一个圆圈较大，并有很多箭头指向这篇文章。那么这篇文章很可能就是这个领域的开山之作。

以上就是软件的简单使用过程。

GCS是global citation score，即引用次数，也就是你咋web of science 站上看到的引用次数。如果你点击gcs，软件会按照GCS进行排序，此时的结果与你在wos 站按被引频次排序的结果是一样的。

CR是cited references，即文章引用的参考文献数量。如果某篇文献引用了50篇参考文献，则CR为50。这个数据通常能帮我们初步判断一下某篇文献是一般论文还是综述。

LCS和LCR是histcite里比较重要的两个参数。

LCS是local citation score的简写，即本地引用次数。与gcs相对应，gcs是总被引次数。lcs是某篇文章在当前数据库中被应用的次数。所以LCS一定是小于或等于GCS的。

在第一部分的介绍中，make graph时，默认是按LCS排序的，也可以选择按gcs排序。你可以比较一下这两者的差异，一般LCS作图，得到的关联较丰富，而gcs作图往往文献之间没什么关联。这就回答了上面开始提出的一个问题，为什么按引用频次排序往往不是很有参考价值的原因。

LCR与CR对应是local cited references，是指某篇文献引用的所有文献中，有多少篇文献在当前数据库中。如果最近有两篇文章，p1 p2,都引用了30篇参考文献，其中p1引用的30篇文献中有20篇在当前数据库，p2只有2篇文献在当前数据库。此时，p1相对更有参考价值，因为它引用了大量和你的研究相关的文献。

根据LCS可以快速定位一个领域的经典文献， LCR可以快速找出最新的文献中哪些是和自己研究方向最相关的文章。

注；引文有些不规范导致引文分析结果偏差，这里暂不做讨论。感兴趣的朋友可以参考引文相关的理论文献或书籍。

三、部分结果示例
这里选择了一个我上课的例子，和学生作业中的例子。更多示例请大家参考中科大生命科学实验中心论坛上学生提交的作业。http;//biotech.ustc.edu.cn/forum

第一个例子是关于合成生物学（synthetic biololgy），2000年之后发展起来的、并在近年广受关注的学科。在wos里以synthetic biology进行检索，2009年10月30日可以获得2297篇参考文献。下载后导入hiscite，按lCS作图；结果如下：

从第一个图可以看出704这篇文献应该是一片开创性的工作，或是一篇重要的综述。后面的1077 1134  1089这三个圆圈较大，说明这几篇文献受到广泛关注，具有较重要的地位。

图2就是相同的数据库按GCS做图得到的结果，可以看到这些文献之间没什么关联。所以在wos中，按引用频次排序，即使排在前面的文献对您也未必有多大参考价值。

（学生作业中对上图的解释：在web of science上检索主题包含G-quadruplex和detection的文章，一共108篇，用histcite作图，该图表明有关将G-quadruplex应用于各种检测的研究工作主要从05年Nagatoishi S;发表在德国应化和He F发表在JACS上的全文开始，逐渐有大量的文章发表，而前述两篇文章的LCS是最高的，其可读性也是非常大，从09年的数据来看，对同年发表的文章的引用次数大大增加，表明该领域在09年的发展迅速。从CR的分析来说，编 为64,55,和1的几篇文章引用文献的数量非常大，应该是综述性文章，对初涉此领域的人也有较大的可读性。）

LCR分析结果

可以看出，排在前10位的都是近期非常具有参考价值的文献。