vmd软件使用

文章目录

  • 软件介绍
  • 适用文件类型
  • 文件格式
  • 软件使用
    • 调出原子和键
    • 调整背景和坐标轴

软件介绍

这是参加 数学建模比赛 时 官方提供的一个分子三维结构展示软件;

适用文件类型

VMD软件适用于 以后缀名 结尾的文件;

  • 原子个数n,能量值,以及n个原子的坐标这三个都是必须要有的,少一个都不能用VMD画出图;
  • 上下原子个数要一致,不能上面写有21个原子,下面却只放20个原子的坐标,这样软件也不会显示结构图;
  • 注意原子坐标的每一行前面都要加上原子类型,这里我是Au,金团簇

软件使用

软件下载链接:https://download.csdn.net/download/wyll19980812/16759262
安装后,直接打开该软件,然后把 文件拖到软件即可,或者直接用该软件打开文件;

调出原子和键

进入 Graphics 的 Representations:

  • 点击下面那个图层 修改 Drawing MethodLicorice

  • 然后点击第一个图层 修改 Drawing Method 为 DynamicBonds,根据距离动态成键;

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