与peakview等软件类似,os在靶向分析中也可以导出一级二级质谱图,主要有3种办法。
第一种,独立的提取每个靶向化合物的一级,
二级
质谱图,之前已经介绍过;这种方法适用于待分析的靶向化合物不多的情况,否则很费时间;
第二种就是利用analytics模块(
链接
),批量导入所有待分析的靶向化合物,批量分析,一般代谢产物分析采用这种办法,比第一种办法快速;
我们来看第二种办法导出谱图的两种办法:
使用analytics模块建立检索方法和提取信息后,得到如下图;
1为提取离子流图,2为待提取离子与实际谱图的对比图,重叠越好,代表匹配度越高,3为二级质谱图,显示模式可以通过调节view改变,可以展示某几个或者所有图;
4为ppm误差(
链接
),表示实测值与精确分子量的误差,一般绝对值在5或者10以内比较可靠,在代谢产物分析中还可以再高一点;5为化合物的保留时间;
如下图,此时,可以直接利用截图工具截取相应的谱图,点击view可以进一步显示某一张或者某几张谱图;
如果对谱图要求比较高,可以按照推文最开始介绍的方法1来导出谱图,这里又有两种办法;
第一种也是最笨的办法,进入explorer模块找到数据文件一个个提取离子,一个个在
IDA模式
寻找二级质谱,然后导出谱图即可;
第二种办法,也是利用第一种办法,借用explorer模块导图,只是不需要手动进入explorer模块,点击7直接从analytics模块跳转explorer;
即可看到如下的图;第一张为提取离子流图,对应上图的1,第二张图对应2,第三张对应3,可以通过双击或者拖拽左键更改谱图显示范围;
如果需要单独导出某张图,点击下图红圈位置,hides all other panes;即可暂时隐藏其他谱图,进而使该张谱图最大化;
此时可以直接ctrl+c ctrl +v复制粘贴谱图到需要的位置保存;
有时候ctrl+c会失灵,主要是edit-copy graph按钮灰色,可能是bug,这时候可以edit-copy window即可,只是此时的图有边框;
图可以放在画图工具或者直接复制到word备用;
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