前几天实验室Boss推荐给我们这款极速提取化学结构软件【StoneMIND Collector】(下文简称Collector),在深度使用两周之后,感觉Collector真的是太好用了,而且还免费!!不敢独享,特分享给大家。下载方式请查看文末链接。
推荐等级:★ ★ ★ ★ ★
使用方便+高准确度识别各类化学结构
Collector可将识别的分子结构一键复制为SMILES/MOL格式,如复制到PubChem数据库的搜索框中,来获得该分子的理化性质、生物活性等信息;也可直接下载分子结构为SDF格式,方便之后的使用。
批量提取2000个结构仅需30分钟!
面对有许多化学结构需要识别的情况,一次性识别多个结构是非常有必要的。使用Collector 页版来进行专利或文献中化学结构的批量提取,只需上传.pdf文件格式或.jpg、.png图片格式文件即可批量提取,专利的批量提取也可直接输入专利 检索提取,提取方法包括支持OCSR(化学结构识别)和IUPAC(标准化学名称识别)两种技术。目前Collector批量提取任务(1个任务对应1个pdf/jpg/png格式的文件)提交后后台会自动提取,待任务结束再查看和下载提取结构即可。
其他超赞功能
在实际的应用中,化学结构的识别往往只是一个开始,思考和发展有利于后续科学研究的功能十分必要。如对于药物设计学家来说,化学分子的理化性质分析及结构的优化功能或许很有用。当然,抛去核心需求的功能更多的是锦上添花,作为化学结构提取的软件,首先应该保证的是快捷性和准确性。笔者看过一些对比数据文章,Collector识别准确度在同类型产品中已处于领先水平,强烈推荐大家使用。
Collector在完成图片抓取后,通过“收藏”选项,可以将结构进行历史保存。重点来了!!!通过打开左侧工具栏的“收藏夹”,会跳转到 页,宝藏出现!!!。
潜在宝藏&分子信息预测
通过上面的界面,大家可以一目了然的看到所谓的“宝藏”,即分子信息的预测。且不仅仅局限于上图中的“类药性、可合成性、溶解度、LogP、hERG”,将收藏的结构进一步点击打开,还会有更为详细的分子信息预测。具体如结构性质方面的类药性、可合成性、氢键受体数目、氢键供体数目、极性分子表面积;理化性质方面的溶解度、logP;DMPK性质方面的Caco-2肠渗透性、生物利用度、血浆蛋白结合率、血脑屏蔽穿透率、PGP底物、CYP450抑制;毒性方面的hERG,等等。这些信息的反馈,对于药学领域研究人员来说,极为珍贵!对于结构的理解,帮助极大!
StoneMIND Collector给出的分子结构预测
综上,就是这个软件当前的使用体验,话不多说,现总结如下:
免费
安装方便,格式较小,兼容性好
界面简单友好
图片结构识别快速
可进行IUPAC(标准化学名称)识别
可输出sdf/mol/smiles格式文件
收藏+历史记录
分子特性预测
多结构同时抓取
Windows & Mac版软件获取方式
Collector由国内AI制药公司北京望石智慧科技有限公司开发,以下信息从官方摘抄
下载地址(复制至PC端浏览器打开,点击下载客户端即可)
https://stonewise.cn/mol_product?channel=9
注意:部分用户可能会遇到软件包的下载安装操作被自动拦截,这受限于您的电脑安全设置策略,请手动允许其下载和安装,该软件安全无毒,请放心使用。
温馨提示
1.在Collector客户端点击左侧导航栏图标,即可观看产品使用视频。
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