菌群多样性分析 告

参考链接https://www.docin.com/p-2107733531.html

在开始实验项目之前,明确实验流程,一步一步获取实验结果,以可视化工具展现结果,并加以生物学意义上的分析,获取完整的分析 告。下面给出菌群多样性分析 告中应包含的大致内容,并对实验流程做出指导性的阐述。

1.项目背景与概况

简单阐述所研究项目的国内外现状,本项目的目的与意义。

2.材料与方法(material and methods)

获取材料的方式主要有:现有数据库下载生物序列;测序实验采集;方法,这一部分内容主要阐述实验流程,各个步骤所采用的技术、算法、工具。

2.1原始数据测定实验流程

2.2数据分析流程

利用原始测序数据以及样本的分组信息进行一系列数据分析,流程如下。

(1)序列预处理和质量控制

(2)OTU划分与分类

划分得到样本的OTUs.获取各OTU的代表序列,通过各OTU所包含的reads数目,创建OTU_table;用于分类level鉴定和系统发育学分析。该分析过程可用一些可视化工具进行分析描述.

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