医学图像处理及三维重建技术 – 相关软件

python三维建模包

FreeSurfer

解析：FreeSurfer是一个处理大脑3D结构像数据，进行自动皮层和皮下核团分割的软件。该软件是一款用于分析脑神

经数据的工具集合，它提供了一系列的算法来量化人脑的功能、连接以及结构属性，能对高分辨率的磁共振图像进行

三维重建，生成展平或胀平图像，并能得到皮质厚度、面积、灰质容积等解剖参数。

FreeSurfer安装，如下所示：

（1）配置环境变量

export FREESURFER_HOME=/home/ssw/freesurfer

source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

（2）yum install tcsh

（3）将license复制到/home/ssw/freesurfer中。

（4）分别输入tkregister2、tkmedit、tksurfer 和recon-all –help。

（5）recon-all -s bert -autorecon1。

Slicer

解析：3D Slicer是一个跨平台的，免费和开源的数据可视化和医学图像计算软件包。

nipy，nibabel

解析：Python医疗影像开发包。pip install nipy-0.4.0-cp27-none-win_amd64.whl；pip install nibabel。

VTK

解析：VTK（visualization toolkit）是一个开源的免费软件系统，主要用于三维计算机图形学、图像处理和可视化。

VTK是在面向对象原理的基础上设计和实现的，它的内核是用C++构建的，包含有大约250,000行代码，2000多个类，还包含有几个转换界面，可以通过Python语言使用VTK。
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