仲辛醇/水体系的界面现象——Lammps与Gromacs计算结果对比

0 引言

 仲辛醇为无色有芳香气味的易燃油状液体. 低毒. 熔点- 38℃. 沸点178~179℃. 闪点88℃. 折射率1.4256. 相对密度0.835. 黏度(20℃)8.2mPa.s. 不溶于水,可溶于醇、醚及氯仿. 
 仲辛醇用作合成纤维油剂、消沫剂以及制取表面活性剂、煤矿用浮选剂和农药乳化剂的原料,也可作为油脂和蜡的溶剂. 

1 模型构建

 仲辛醇分子由Material Studio 2019软件构建,将PDB文件上传至ATB(Automated Topology Builder)ATB(Automated Topology Builder)经过量子力学计算优化后的几何结构用于本次模拟计算.

 仲辛醇分子的结构信息(2-Octyl.XYZ)

 本次研究仲辛醇/水体系,采用

 PACKMOL模型构建代码(model.inp)

 采用SPC/E水模型,首先对体系进行能量最小化 ,减少分子间的不合理重叠现象,消除应力. 接下来将模拟盒子扩大至

2 结果与讨论

未完待续

2020/5/13

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