蛋白质的三维结构决定了蛋白质的功能,施一公老师在15年发表的几篇重量级的文章都是关于蛋白质三维结构解析的。我们今天不介绍如何通过实验得到蛋白质三维结构,今天我们介绍如何查看已有的蛋白质三维结构。
1 我们首先下载蛋白质三维结构查看软件pyMol(http://www.keyangou.com/tools/software/),下载后直接安装,注意路径名不能有中文。
2 接下来我们去哪里找三维结构呢上ncbi的数据库structrue,我们搜索p53,打开如下页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgid=103701
主要分为两个部分,上面的是命令行区域,下面黑色的是显示区域。
4 我们通过“File->open”打开刚才下载的PDB文件:
show mesh
8 我们可以标记我们自己感兴趣的氨基酸,比如我们想标记里面所有的亮氨酸为红色
Color red,resn leu
10 上面都是截图,效果不是太好,我们想得到一张清晰的图片,可以使用命令:
ray
png E://abc.png
上面就是将当前视图渲染到 E盘的abc.png中
相关资源:软件滤波杂汇-C代码类资源-CSDN文库
声明:本站部分文章及图片源自用户投稿,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!