r语言在linux下取数据,菜鸟第一步，跪在数据处：R语言读取数据

1. 温故知坑

实践是学习知识的最好途径。之前我讲的内容都非常非常基础，包括：

(1)什么是R语言言和Rstudio软件的安装，Rstudio的界面介绍；

(2)R语言的基本逻辑，基本数据类型；

(3)ggplot基础绘图；

(4)学习R语言的思路(整理，总结问题)。

通过不断的踩坑，走弯路，我们可以在勤奋的基础上，找一些快速的方法。我们已经不能再像上大学时候一样了，先啃完一本书，学好各种基础知识，然后开始应用。工作之繁忙，生活之琐碎，各种被电子产品占据走的时间。已经很难找出一整块的时间去学习了。

换句话说，没有目的性的理论学习就是耍流氓。怎么讲这么多数据类型，格式，可是我用不着呀，我们调整策略，按照完成project为主线来解说在完成数据分析的过程中，我们需要用的R语言知识。

2. 一个超级简单的project流程

以我之前处理的GEO数据为蓝本，我们详细的介绍每一个数据处理过程，所需要的知识(不仅仅是R语言代码，还有各种背景知识)。

步骤基本上是：导入数据–整理为可以进行分析的形式–差异分析(火山图等)–GO/KEGG注释(各种好看的图)。其中每一个步骤都可以说是好几把辛酸泪。

但素！为了降低炸毛的风险，我自己捏造了一段非常非常小的数据用来做示例。想要跟着我步骤的小伙伴，需要这小小数据，你们可以想办法找到我。

so，今天我们来讲，导入数据！

(1)首先自然是要有数据

step1-2.png

step 3 将Excel另存为csv文件，而后载入

## (1)另存为csv文件之后，以下代码均可以读取数据

data_1

data_2

## 知识点，header= T，sep=”,” 是什么意思p>

> colnames(data_1)

[1] “ensembl_id” “control_1” “control_2” “control_3” “experiment_1” “experiment_2”

[7] “experiment_3”

## 那什么是sep=”,” 你试试看不要这么参数嘛！

step 4 我偏不另存为，我就要读Excel

好的，妥妥的满足你！虽然我不会，但是我去话了小洁大佬，她支的招就是，使用R包 tidyverse

## (2)我偏不另存为，那就试试tidyverse包

install.packages(“tidyverse”)

library(tidyverse)

## 调出帮助文档，学习如何使用该包

dyverse

## 可是我怕不想看帮助文档怎么办的我发现了一个小妙招

请看图

loaddata.jpg

至于txt文档怎么载入，我想你用到的时候，定会查到的！

3. 还是温故知新的！

其实写这篇推文呢，我才是最大的收获者，为了写得简洁明了，我回去自己看了一下书，然后又请教了小洁，真是妥妥的–温故知不足，求索方知新。大家加油吧！

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