piRNA-疾病研究最新综述 – 数据库、软件工具、webserver和计算模型

piRNA被世界顶尖科学期刊《Science》评为2006年年度十大科学突破之一。之后有关piRNA的研究也成为CNS文章的常客。

1，piRNA的产生

1）通常piRNA簇转录产生单链piRNA前体

2）piRNA前体从细胞核转运到细胞质

3）转运到细胞质的piRNA前体被内切核酸酶切割，产生单磷酸化末端，并与PIWI蛋白结合，进入独特的piRNA生物发生通路 – 乒乓循环（ping-pong cycle）。

2，piRNA的功能

成熟piRNA的3’末端包含2’-O甲基化修饰，与PIWI蛋白结合以行使功能，包括通过招募染色质修饰因子抑制转录元件转录，或者类似miRNA的方式通过碱基互补配对识别并切割mRNA。最新研究发现piRNA具有增加翻译，稳定mRNA等功能。

3，piRNA与疾病

5，piRNA算法与工具

6. 研究挑战

1）缺乏统一命名规则

例如DQ569913，hsa_piRNA_32046，piR-30025等都是piRNA的名字，因此计算piRNA的时候，需要以序列为基准进行分析。

2）缺乏特定piRNAs在疾病过程中作用的实验验证。

3）缺乏piRNA其他应用领域的工具，例如进化。

4）已研究的piRNA物种相对偏少

因此，piRNA研究未来可期！

更多细节和工具请查看原文：

PIWI-interacting RNAs in human diseases: databases and computational models

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