ASReml 软件简介

什么是ASReml 软件？

ASReml是专为混合线性模型而设计的数据分析软件，它支持大数据分析及高级的统计模型 。除此之外，ASReml也开发有与R 语言兼容的软件包。

ASReml 软件功能：

ASReml 1993年由澳大利亚产业部和洛桑试验站共同开发。ASReml专为线性混合模型而生，目前广泛应用于动植物育种和农业试验、环境科学、医药研究等领域，对有大数据分析需求的科研人员来说，是一个非常重要的工具。目前已更新至ASReml-SA 和ASReml-R4。

ASReml应用Reml 法，并结合Average Information (AI)和稀疏矩阵算法法，对处理大型数据和复杂模型非常有利(500,000效应以上)，可灵活多变的定义随机效应和残差项 。

ASReml 优势：

其引擎为REML算法，并结合平均信息算法(AI)和稀疏矩阵(Sparse matrix)，能够快速、准确的完成大型数据复杂模型的分析。

主要适用于大型数据混合线性模型的拟合分析，随机项和残差项定义简便灵活

ASReml 主要应用于：

分析半同胞、全同胞、父本模型、动物模型等模型

计算BLUP育种值

处理重复测量数据

处理平衡非平衡的试验设计

处理多环境试验（MET）和元分析（meta-analysis）

处理规则和不规则的空间分析数据

计算遗传力、重复力、遗传相关、表型相关等遗传参数

处理基因组数据，估计GBLUP

ASReml-R 4新升级功能：

在第四版中我们做了很多开发和更新工作，包括命名法更加合理和统一，更规范的模型写法和输出对象，和一些扩展函数功能等。例如：

拟合随机回归模型的计算更高效，特别是针对变量比观测值更多维的模型，这种情况在使用SNP分子标记时比较常见

拟合在方差结构参数的线性关系

方差分量及其标准误的近似计算

计算信息量。

更简单，一致和更适用模型残差的直和结构。通常发生在观察值需要分区，需要分别定义它们的方差结构时。如，在多环境（MET）分析中，每一个地点需要分别定义他们的空间结构和残差结构

更加简洁和统一地规范和拟合已知的方差矩阵，包括亲缘关系矩阵, 以及对奇异阵的补充

own() 新函数，允许用户自定义方差结构

广义线性模型的扩展，包括阈值模型，多变量模型中一个变量服从高斯分布，另一变量符合其它指数分布

生成设计矩阵

预测模型中，可生成因子水平的组合或水平的子集的函数

好了，以上就是对遗传育种评估软件ASReml 软件的简单介绍，如果您想要了解更多功能，咱们评论区见哦！