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细菌、真菌和病毒是微生物的主要类群，它们在自然界中广泛分布，种类繁多。微生物计数是微生物学的一项重要内容。
微生物的形态结构特征决定了其计数方法的多样性：如根据菌落的大小、形状、色泽等不同来分类计数；根据培养物上是否有鞭毛来判断是否属于需氧菌或厌氧菌等等；此外还可以通过测定细胞壁厚度（即厚度的单位）来确定细菌的属种。
目前常用的有平板划线法（又称涂片染色法），稀释度法和微量管滴定法三种。
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