MedCalc:医学研究的专用统计工具

MedCalc是Medicine和Calculator的缩写的组合,顾名思义,她是一款医学计算器软件。然而“计算器”这个名字显然不能充分反映该软件的性能,她是一个集统计、绘图、汇总数据检验和样本量计算于一身的精巧统计软件。她和SPSS及Minitab一样,也是图形窗口界面,不需要任何语法命令编写,只需鼠标操作即可,其早期版本只有英语一种语言,MedCalc的新版本可支持多国语言,极大地方便了母语是中文的用户。然而与SPSS及Minitab相比,MedCalc具有很多特有的功能,最为人熟知的是ROC曲线下面积的比较功能。下面我们以最新版的MedCalc 16.4为例介绍一下她的统计、绘图、汇总数据检验及样本量计算功能。与SPSS比较,其特有的统计功能用高亮颜色显示。

一、统计(Statistics)功能

1.1 汇总统计(Summary statistics)。

1.2 异常值检测(Outlier detection)。

1.3 分布图(Distribution plots):直方图(Histogram)、累积频率图(Cumulative frequency distribution)、正态图(Normal plot)、点图(Dot plot)、箱图(Box-and-whisker plot)。

1.4 相关(Correlation ):相关系数(Correlation coefficient)、偏相关(Partial correlation)、秩相关(Rank correlation)、散点图(Scatter diagram)。

1.5 回归(Regression):回归(Regression)、散点图和回归线(Scatter diagram & regression line)、多重回归(Multiple regression)、Logistic 回归(Logistic regression)、概率单位回归(剂量反应分析)(Probit regression (Dose-Response analysis))、非线性回归(Nonlinear regression)。

1.6 t检验(T-tests):单样本t检验(One samplet-test)、独立样本t检验(Independent samples t-test)、配对t检验(Paired samples t-test)。

1.7 秩和检验(Rank sum tests):单样本符 秩和检验(Signed rank sum test (one sample))、独立样本的Mann-Whitney 检验(Mann-Whitney test (independent samples))、配对样本的Wilcoxon检验(Wilcoxon test (paired samples))。

1.8 方差比检验(F检验)(Variance ratio test (F-test))。

1.9方差分析(ANOVA):单向方差分析(One-way analysis of variance)、双向方差分析(Two-way analysis of variance)、协方差分析(Analysis of covariance)、重复测量方差分析(Repeated measures analysis of variance)、检验(Kruskal-Wallistest)、Friedman 检验(Friedman test)。

1.10 交叉表(Crosstabs):卡方检验(Chi-squared test)、Fisher 精确检验(Fisher’s exact test)、McNemar 检验(McNemar test)、Cochran Q检验(Cochran’s Q test)、相对风险与优势比(Relative risk & Odds ratio)、频率条图(Frequencies bar charts)。

1.11 生存分析(Survival analysis):Kaplan-Meier 生存分析(Kaplan-Meier survival analysis)、Cox比例风险回归(Cox proportional-hazards regression)。

1.12 Meta分析(Meta-analysis):连续资料(Continuous measure)的Meta分析、相关(Correlation)系数的Meta分析、率(Proportion)的Meta分析、相对风险(Relative risk)的Meta分析、风险差别(Risk difference)的Meta分析、优势比(Odds ratio)的Meta分析、ROC曲线下面积(Area under ROC curve)的Meta分析、一般逆方差法(Generic inverse variance method)。

1.13 序列测量(Serial measurements)。

1.14 参考区间(Reference intervals ):参考区间(Reference interval)、年龄相关参考区间(Age-related reference interval),即正常值估计。

1.15 方法对比和评价(Method comparison & evaluation):Bland-Altman图(Bland & Altman plot)、每个对象多次测量的Bland & Altman 图(Bland-Altman plot with multiple measurements per subject)、多个方法的比较(Comparison of multiple methods)、山形图(Mountain plot)、Deming 回归(Deming regression)、Passing-Bablok回归(Passing & Bablok regression)、重复测量的变异系数(Coefficient of variation from duplicate measurements)。

1.16 一致性与响应能力(Agreement & responsiveness):组内相关系数(Intraclass correlation coefficient)、一致性相关系数(Concordance correlation coefficient)、评分者间的一致性(κ系数(Inter-rater agreement (kappa))、Cronbach α系数(Cronbach’s alpha)、响应能力(Responsiveness)。

1.17 ROC曲线(ROC curve ):ROC 曲线分析(ROC curve analysis)、交互点图(Interactive dot diagram)、图与标准值(Plot versus criterion values)、预测值(Predictive values)、区间似然比(Interval likelihood ratios)、比较ROC曲线(Comparison of ROCcurves)。

1.18 创建表格(Create tables):汇总统计表(Summary statistics table)、关联表(Correlation table & Correlogram)、独立样本比较(Comparison of independent samples)、配对样本比较(Comparison of paired samples)。

二、统计图形

2.1 数据对比图(Data comparison graphs):包括条图、线图、箱图、凹口箱图、点图等。

2.2 多重对比图(Multiple comparison graphs):包括条图、线图、箱图、凹口箱图、点图等。

2.3 复式多重对比图(Clustered multiple comparison graphs):包括条图、线图、箱图、凹口箱图、点图等。

2.4 多变量图(Multiple variables graphs):包括条图、线图、箱图、凹口箱图、点图、累积频率分布图等。

2.5 复式多变量图(Clustered multiple variables graphs):包括条图、线图、箱图、凹口箱图、点图、累积频率分布图等。

2.6 多线图(Multiple line graph)。

2.7 控制图(Control chart)。

2.8 Youden 图(Youden plot)。

2.9 极坐标图(Polar plot)。

2.10 森林图(Forest plot)。

2.11 函数图(Function plot)。

三、汇总数据的检验(Test)功能

3.1 单样本均值的检验(Test for one mean)。

3.2 单样本率的检验(Test for one proportion)。

3.3 卡方检验(Chi-squared test),可以进行趋势性卡方的计算。

3.4 四格表的Fisher精确检验(Fisher’s exact test for a 2×2 table)。

3.5 配对率的McNemar检验(McNemar test on paired proportions)。

3.6 平均值(Means):均值的比较(t检验)(Comparison of means (t-test))、标准差的比较(F检验)(Comparison of standard deviations (F-test))、相关系数的比较(Comparison of correlation coefficients)、两个率的比较(Comparison of two proportions)、ROC曲线下面积的比较(Comparison of areas under independent ROC curves)。

3.7 率(Rate):率的置信区间(Confidence interval for a rate)、两个率的比较(Comparison of two rates)。

3.8 相对风险(Relative risk)。

3.9 优势比(Odds ratio)

3.10 评分者间的一致性(Inter-rater agreement)。

3.11 诊断试验(Diagnostic test)。

3.12 2×K表的似然比(Likelihood ratios (2xk table))。

四、样本量的计算:抽样(Sampling)功能

4.1单个均值(Single mean)的样本量计算。

4.2 单个率(Single proportion)的样本量计算。

4.3 两个均值比较(Comparison of two means)的样本量计算。

4.4 两个率比较(Comparison of two proportions)的样本量计算。

4.6 相关系数(Correlation coefficient)的样本量计算。

4.7 ROC曲线下面积(Area under ROC curve)的样本量计算。

4.8 两个ROC曲线比较(Comparison of two ROC curves))的样本量计算。

4.9 生存分析(logrank 检验)(Survival analysis(logrank test) )的样本量计算。

诚然,与SPSS及Minitab相比,MedCalc的确具有许多医学研究所需的特有统计功能,然而统计学具有共性,其他专业的研究者也是可以使用MedCalc进行统计分析的。当然医学研究的特有统计功能也是非常适合与医学类似或相近的领域的,如生物学、动植物物学、检验学及其相关的专业。

李志辉,长期从事各类统计软件应用研究,《SPSS常用统计分析教程(SPSS 22.0中英文版)(第4版)》等教材的主编,主编或参编SPSS、MINITAB、STATISTICA多个统计软件教材共8本。

更多的学习资料请前往同名微信订阅 “一起学SPSS”获取。

声明:本站部分文章及图片源自用户投稿,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!

上一篇 2016年6月2日
下一篇 2016年6月2日

相关推荐