CADD课程学习(3)– 靶点药物相互作用(PyMol)

CADD课程学习(3)– 靶点药物相互作用

PyMol软件教程

CADD课程学习(3)-- 靶点药物相互作用(PyMol)

基本操作

任意旋转图像:对准图像的任意处点住鼠标左键然后移动鼠标
放大/缩小图像:对准图像的任意处点住鼠标右键然后移动鼠标(向上是缩小,向下则是放大)
移动图像:对准图像的任意处点住鼠标中键或者滚轮,然后移动鼠标命令行输入:fetch 1lEP

从PDB数据库 站下载晶体结构1lEP,在pymol打开

  • Step1:改变界面颜色(Display一Background-White)
  • Step2:删除蛋白B链,在命令行输入‘remove chainB’,按回车键
  • Step3:删除离子和水分子(14.75和129 水分子与配体有相互作用,故保留):在序列信息一栏选中氯离子和对应水分子,操作对象sele
    (Action-remove atoms)

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