MPB:山大倪金凤组-?黄翅大白蚁后肠几丁质降解微生物的分离与培养

图 1. 8株几丁质降解菌的培养特征

二、16S rRNA序列分析

纯化后的菌株,通过16SrRNA基因测序,然后对其序列进行比对分析,发现它们属于不同属的菌株。它们分别与Flavobacterium oceanosedimentum,Dactylosporangium salmoneum,Brevibacillus borstelensis,Sphingomonas koreensis,Paenibacillus odorifer,Cellulomonas flavigena,Stenotrophomonas panacihumi和Bacillus cereu 相似度最高,相似度均大于97%(表1)。其中黄杆菌属Flavobacterium、指孢囊菌属Dactylosporangium和纤维单胞菌属Cellulomonas属于放线菌菌门,鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas和寡养单胞菌属Stenotrophomonas属于变形菌门,短芽孢杆菌属Brevibacillus、类芽孢杆菌属Paenibacillus和芽孢杆菌属Bacillus属于厚壁菌门 (图2)。

表1. 8 株几丁质降解菌16S rRNA 的序列在GenBank中的比对结果

菌株编

Strains

相似性最高菌株

Most similar strain in NCBI

GenBank登录

Accession number

相似性

Similarity (%)

chi-1

Flavobacterium oceanosedimentum

EF592577

99.7

chi-2

Dactylosporangium salmoneum

FJ973607

99.5

chi-3

Brevibacillus borstelensis

D78456

98.2

chi-4

Sphingomonas koreensis

AF131296

98.3

chi-5

Paenibacillus odorifer

CP009428

99.5

an-chi-1

Cellulomonas flavigena

CP001964

98.3

an-chi-2

Stenotrophomonas panacihumi

GQ856217

99.6

an-chi-3

Bacillus cereus

AE016877

99.4

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