刚写题目时发现，现在的分析应该是RNA-seq与ChIP-seq杂合在一起的分析了，为了省事还接着在这个系列写吧。最近有站友发私信建议说把代码跑出来的结果放上，方便学习。这里说明一下：关于学习笔记我尽量把图片放上来，对于分析的记录，因为涉及到实验室的课题，为了避免不必要的麻烦就不放了，本意这个记录就是自己的试验记录，记录下代码过程，为以后学生发表文章参考。
1. 根据gene_list从hg19_genes.gtf文件中提取gene_TSS信息
也可以使用biomaRt包进行注释，中间出错尚未解决，有机会再尝试。
2. 根据gene_TSS信息利用bedtools getfast从hg19_genes.fasta文件中提取promoter的序列
输出结果如下：
3. 根据gene_promoter信息利用meme软件进行分析
分析软件meme使用conda install命令进行安装【这个软件安装费了很大劲】
建立python=2.7的新环境
安装python=2.7的版本
启动相关环境并安装特定版本的meme软件和支持软件icu
查看软件帮助以检查安装效果
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