structure 2.3.4 软件使用指南

1. 软件下载

structure
Windows版建议安装桌面版(graphical front end), Linux建议安装终端版(without front end)

Mac OS X
软件包是一个可执行文件, 双击, 会打开软件, 创建一个快捷方式即可.

示例数据

定义行

• 勾选: Row of marker names
• 勾选: Row of recessive alleles

7. 定义参数

开始运行:

10. 使用admixture指定群体

pop文件特点, 前缀和ped或者bed前缀一样, 一行内容, 如果已知群体, 定义群体名称, 如果未知, 用或者空格表示, 单独一行.

比如, 如果9个个体, 6个知道群体类型,3个不知道群体类型, 定义如下:

运行命令时, 加上参数:

这里, , 为手动生成的文件, 生成代码如下:

绘图:

PS

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