随着组学研究日趋成熟与完善,生物信息学数据可视化显得尤为重要!不会R语言的小白该如何绘制炫目多彩的生信相关图片呢天半夏给大家分享一些免费、实用的生信数据可视化与模式图、流程图绘图神器给大家!
在线神器的优点有:1. 免费且不依赖电脑操作系统、无需安装,一个浏览器即可实现高质量的绘图;2. 无需编程基础,阅读说明即可绘图;3. 可绘制图像种类多,可导出矢量图;4. 高效,节省时间。
1、微生信在线生物信息学数据可视化
微生信目前能做文献中常见的50多种生信相关矢量图,其 址为:http://www.bioinformatics.com.cn/ 。
微生信可以绘制多种图形,界面左侧显示能作的图形种类,右侧是具体图形:
输入数据,首行为group名字,第二行为样品名字,其余为数据(其中第一列是基因名),设置图像大小、字体大小:
得到的热图如下,保存图片时默认svg矢量图,在生成的图上点击鼠标右键,在弹出的窗口中选择另存为(直接是svg格式文件,文件后缀不用改):
选择按照gene排序,得到结果:
输入数据:
得到火山图:
(4)韦恩图(Venn diagram)
韦恩图(Venn diagram)是各类组学分析中的重要展示结果之一,可显示各比较组之间共有和特有的基因或蛋白。
最多可以绘制6个组的韦恩图,输入数据与组名,点击颜色正方形可以设置颜色:
上述操作完成后即可得到对应的韦恩图:
微生信其他的绘图功能等待大家的探索与使用!
2、联川生物在线分析与绘图
联川生物在线绘图 址:http://www.lc-bio.cn/overview 。
分析包括主坐标分析、主成分分析、OTU气泡图与非度量多维尺度分析:
(1)绘制聚类热图
联川生物云平台对每种分析与绘图功能有详尽的使用方法解释与说明:
(2)GO富集因子图
其他分析与绘图功能大家可以自行根据说明去绘制!
3、在线绘制韦恩图
超过6组的韦恩图该如何绘制恩图的绘制还有其他一些好用的在线工具可以分享给大家!
(1)Venny 2.1绘制韦恩图
Venny 2.1链接:https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html 。
Venny 2.1最多可以绘制4组的韦恩图,点击数字可以查看结果,右击可查看并保存绘制图片:
(2)Draw venn diagram绘制韦恩图
Venny 2.1的限制是最多绘制4组的韦恩图,4组以上的韦恩图绘制就无能为力了,而Draw venn diagram可最多可以计算30个List的韦恩图。
Draw venn diagram链接:http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/ 。
Draw venn diagram的使用:
在线绘图时使用邮箱注册并登录BioRender,Help Guide可以查看使用指南,My Gallery处可以选择Start with a template(从模板开始),点击See all template可查看所有模板:
选择创建新图表,http://Draw.io 内置了很多图表模版,可以按需创建:
例如选中图形可以更改其填充颜色、输入文本与调整图形等:
点击左上角文件,可导出已绘制好图片:
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相关资源:SAI绘画软件v1.3.1.0汉化绿色免费版_SAI-其它代码类资源-CSDN文库
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