使用开源软件的用户时常会碰到软件出现问题（Bug），但大多数问题不影响使用，而且对于同一种任务，可以有多种开源软件可以选用。
不能对开源软件的可靠性提出更高的要求，毕竟其中大多数是由志愿者开发的，项目管理不可能达到商用软件的水平。弥补这种缺陷的一种方法就是不断升级（或者是打补丁），升级后的版本也未必能保证与老版本完全兼容，但在多数情况下不影响使用。
对可靠性要求不高的是桌面应用软件，个人用户使用这类开源软件的途径是不断尝试，只要不破坏系统，不破坏数据，就可以选用，用久了，自然就顺手了。
例如在桌面应用软件方面，微软Office软件的开源软件对手是OpenOffice、LibreOffice以及OxyzenOffice等，其实这些Office软件功能差不多，用户可以使用OpenOffice，如果发现它不支持Office 2010格式，可以换用LibreOffice，微软Office能处理的文档，LibreOffice都可以处理。
对可靠性要求较高的是核心服务软件，企业用户使用这类开源软件是需要仔细掂量掂量的！
例如在核心服务软件方面，微软SQL Server的开源软件对手是MySQL或PostgreSQL，不能说MySQL或PostgreSQL不可靠，但至少不如SQL Server可靠。如果出了问题，架构在MySQL或PostgreSQL上的整个业务系统都将受影响，更要命的是没有软件生厂商为此负责。如果SQL Server出了问题，至少还有微软要为此担责。
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