使用MolAICal进行药物设计
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- MolAICal 教程
- MolAICal开发版(Development version)教程
MolAICal简介
MolAICal可以通过人工智能深度学习和经典算法程序进行药物设计。
MolAICal相关信息如下:
MolAICal官方主页:https://molaical.github.io
MolAICal官方主页中国镜像:https://molaical.gitee.io
MolAICal 文章介绍:https://arxiv.org/abs/2006.09747 和 https://doi.org/10.1093/bib/bbaa161
MolAICal中文博客:https://molaical.gitee.io/cntutorial.html
MolAICal Leader and Developer:Qifeng Bai
MolAICal QQ学术讨论群: 1151656349
MolAICal 教程
0.用MolAICal进行分子对接
1.用MolAICal快速进行从头药物设计
2.用MolAICal的深度学习模型和经典算法程序进行GCGR的从头药物设计
3.用MolAICal的深度学习模型和分子对接程序进行药物的虚拟筛选
4.用MolAICal两步实现对Mpro蛋白活性口袋的虚拟筛选
5.用MolAICal基于NAMD模拟结果计算小分子和蛋白MM/GBSA的教程
6.用MolAICal计算纳米管和蛋白质孔道半径的教程
7.用MolAICal进行药物的QSAR计算
8.用MolAICal软件计算Potential of Mean Force(PMF)
9.用MolAICal计算配体和受体结合能力的vinardo打分函数
10.用MolAICal计算分子合成可行性预测、类药五原则和PAINS的教程
11.据常数Kd, Ki, pKd或者pKi使用MolAICal计算结合自由能的操作教程
12.用MolAICal进行配体相似性比较或搜索的操作教程
13.用PyInstaller打包MolAICal软件深度学习模型“AIGenMols”的例子
14.用MolAICal将分子切割成片段
15.用MolAICal和OnionNet模型进行药物亲和力的预测
16.用MolAICal和Pafnucy模型对药物亲和力进行预测
17.用MolAICal进行分子生成和药物改造教程
18.用MolAICal对虚拟筛选结果进行聚类
MolAICal开发版(Development version)教程
注意:本部分教程仅适用于MolAICal的开发版本。如果MolAICal的新版本发布之后,下面的教程将移到上面,请在上面部分找到相关教程。
19. 使用MolAICal进行药物ADMET的预测和分子属性的计算
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