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iMeta——国人的微生物组、生物信息国际顶刊

高影响力期刊iMeta扬帆起航(微生物组&生物信息)
iMeta期刊投审稿系统ScholarOne正式上线
iMeta期刊12名编委入选科睿唯安2021年度高被引学者
iMeta宏基因组&生物信息期刊-创刊背景和简介
iMeta期刊顾问James M Tiedje当选中国科学院外籍院士
告视频录制：腾讯会议录屏+人像画中画特效
中国大陆SCIE收录期刊分析：多少本刊文多少决了多大内卷来在哪里
微生物领域SCIE期刊分析(英美各40本，中国大陆0本)

《微生物组数据分析》专著

众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人(目录)
编者序：初衷、计划、要求、优势、目标和展望
111.Protein Cell：扩增子和宏基因组数据分析实用指南
112.CMJ：人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南
121.个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac)
122.Linux系统和Shell命令行简介，走上数据分析之路
123.R简介和统计绘图
211.Alpha多样性箱线图(样章，11图2视频)
212.样本量和测序深度的Alpha多样性稀释曲线
213.维恩图和集合图(Venn&Upset)
221.Beta多样性PCoA和NMDS排序
222.Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA
223.主成分分析PCA
231.菌群物种组成堆叠柱状图、弦图、词云
245.热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵
246.三元图的应用与绘图实战
251.全最简单的络图画法，小白福音包学包会
252.体现组间差异OTU模块的微生物络图
341.基于高通量测序的微生物组研究技术简介
342.基于高通量技术的微生物组研究实验设计
343.微生物组研究写作的一般思路
西湖大学鞠峰组：环境宏病毒组学分析思路与常用工具
西湖大学鞠峰组：环境微生物的宏基因组学实例与新发现
ggClusterNet—-一条代码完成全内容微生物络
Windows10安装Linux子系统Ubuntu 20.04LTS，轻松使用生信软件，效率秒杀虚拟机
宏基因组领域杂志简介及最新影响因子

《微生物组实验手册(MPB)》专著

125家单位联合完成微生物组实验手册(Microbiome Protocol eBook)第1版
352位华人学者联合发布《微生物组实验手册》
MPB：北林张静等-丛枝菌根真菌(AMF)孢子、菌丝密度及侵染率定量测定方法
MPB：地大郭东毅等-一种针对重金属污染土壤的高效DNA提取方法
MPB：西农焦硕组-土壤微生物响应环境变化的系统发育保守性和环境阈值
MPB：农科院牧医所赵圣国组-基于GraftM对功能基因进行物种注释
MPB：农科院牧医所赵圣国组-微生物超高分子量DNA提取方法
MPB：山大倪金凤组-培菌白蚁肠道簇虫分离与分子鉴定的方法
MPB：沈阳生态所李琪组-土壤线虫群落DNA提取、扩增及高通量测序
MPB：中大李文均组-河口水体和沉积物中微生物的分离培养与鉴定
MPB：上海巴斯德所崔杰组-RNA病毒组与生物信息学分析
MPB：中科院城环所杨军组-淡水浮游动物的采集及鉴定
MPB：甘肃省科学院祝英等-药用植物地下茎内生真菌的分离纯化及鉴定
MPB：农科院牧医所赵圣国组-微生物DNA、RNA和蛋白质共提取方法
MPB：林科院袁志林组-利用acdSf3/acdSr4引物快速鉴定产ACC脱氨酶细菌
MPB：遗传发育所白洋组-高通量分离培养和鉴定植物根系细菌
MPB：清华杨云锋组-利用GeoChip分析环境微生物功能基因群落结构
MPB：西农焦硕组-微生物生物地理学研究方法
MPB：川农罗玉衡组-猪肠道食糜和血清中短链脂肪酸浓度的测定
MPB：青岛大学苏晓泉组-使用Meta-Apo对16S扩增子的微生物组功能信息进行校正
MPB：南土所褚海燕组-利用种分布模型绘制微生物分布图谱
MPB：林科院袁志林组-一种简易的植物组织表面消毒装置
MPB：林科院袁志林组-内生镰刀菌基因组染色体级别组装和注释
MPB：林科院袁志林组-毛白杨根系内生真菌互作体系构建方法
MPB：青岛大学苏晓泉组-全球微生物组整体结构和功能的搜索
MPB：中大李文均组-热泉高温细菌分离培养方法
MPB：水稻根系微生物组研究中的样本种植、取样和16S rRNA基因扩增子文库制备方法
MPB：中科院城环所杨军组-淡水浮游细菌群落采集、过滤与保存
MPB：利用无菌植物和可培养细菌体系研究根系微生物组功能
MPB：南京湖泊所王建军组-群落构建过程的定量指标——扩散-生态位连续体指数
MPB：扬州大学王梦芝组-反刍动物瘤胃原虫的分离培养与形态学分析
MPB：使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据(视频)
MPB：林科院袁志林组-树木共生真菌菌株纯化及快速鉴定方法
MPB：湖南师大尹佳组-乳酸菌对酸和胆碱盐的耐受能力
MPB：中科院城环所杨军组-基于DNA宏条形码的水体浮游细菌群落测序建库方法
MPB：湖南师大尹佳组-乳酸菌益生菌表面粘附能力的检测
MPB：华大孙海汐等-从细菌基因组中预测活性前噬菌体工具Prophage Hunter的使用流程和常见问题
MPB：生态环境中心陈保冬组-基于高通量测序技术的丛枝菌根真菌多样性研究方法
MPB：农科院田健、韩东飞等-水稻根系互作功能微生物的筛选方法
MPB：南农成艳芬组-瘤胃厌氧真菌代谢产物的检测方法
MPB：扬大林淼组-瘤胃混合细菌连续传代培养技术
MPB：扬大林淼组-瘤胃内容物样本中有机酸的定量分析 (高效液相色谱)
MPB：陈同等-ImageGP在微生物组可视化中的应用视频
MPB：林科院袁志林组-原生质体法制备根系腐生型共生菌(伞菌目)单核化菌丝
MPB：扬州大学王梦芝组-反刍动物瘤胃原虫与细菌微循环测定方法
MPB：遗传发育所刘永鑫等-易扩增子：易用、可重复和跨平台的扩增子分析流程
MPB：亚热带生态所葛体达组-原位酶谱法高分辨率实时检测土壤微界面酶活分布
MPB：亚热带生态所谭支良组-基于微生物成分数据的差异zOTU分析流程
MPB：生态环境中心张丽梅组-植物微生物组DNA提取扩增及溯源分析(视频)
MPB：微生物所东秀珠组-基于16S rRNA基因和基因组序列对细菌物种的初步鉴定
MPB：白酒酒醅非破坏性连续采集与核酸提取
MPB：中大魏泓组-无菌小鼠肠道粪菌移植(视频)
MPB：北林袁峥嵘组-16S扩增子分析中常用软件及数据库应用现状
MPB：南土所褚海燕组-小麦相关微生物的野外采样与样品保存
MPB：南土所褚海燕组-小麦相关微生物的野外采样与样品保存
MPB：上海交大肖湘组-海洋微生物的厌氧高压培养实验
MPB：上海交大王风平组-海洋沉积物样品细胞提取及荧光显微镜计数法
MPB：南京湖泊所王建军组-湖泊沉积物的野外采集方法
MPB：南京湖泊所王建军组-溪流底栖附着生物膜的野外采集方法
MPB：中科院生态环境中心邓晔组-从环境样本中提取高质量DNA-研磨加DNeasy试剂盒方法
MPB：林科院袁志林组-巢式PCR检测植物组织痕量内生真菌的方法及其引物
MPB：中农冯固组-研究菌丝际微生物互作的胡萝卜根器官-丛枝菌根真菌双重培养体系
MPB：西农郑伟-土壤水稳性团聚体微生物组样品制备方法
MPB：山大倪金凤组-白蚁肠道微生物样品收集与制备
MPB：湖南师大尹佳组-乳酸菌的耐热实验
MPB：中科院城环所杨军组-水体浮游植物采集与鉴定
MPB：中科院城环所杨军组-基于DNA宏条形码的水体微型真核生物群落18S测序建库方法
MPB：中农戴兆来组-猪肠道微生物样品的采集与核酸提取
MPB：南农成艳芬组-瘤胃体外发酵过程中产气量与甲烷产量的检测
MPB：南农金巍等-瘤胃甲烷菌的分离培养与保存
MPB：南农韦中组-根际细菌产铁载体能力的高通量检测
MPB：中农戴兆来组-猪肠道微生物的体外培养与功能研究
MPB：中科院植物所杨文强组-莱茵衣藻遗传连锁分析方法
MPB：中南大学刘学端、马丽媛组-基于16S测序和RT-qPCR的硫化矿物表面微生物群落组成分析
MPB：山大倪金凤组-黄翅大白蚁后肠几丁质降解微生物的分离与培养
MPB：中科院南土所褚海燕组-结构方程模型在土壤微生态中的应用
MPB：南农成艳芬组-瘤胃厌氧真菌的分离培养与保存
MPB：南农成艳芬组-瘤胃微生物体外发酵过程与注意事项
MPB：华中农大谢卡斌组-CRISPR靶向消除16S-seq中植物序列的方法
MPB：北大口腔陈峰、陈智滨等-口腔微生物组研究主要取样部位及方法
MPB：华南农大王文策组-水禽粪便微生物移植技术(视频)
MPB：中农冯固组-利用13C-DNA-SIP法示踪根际和菌丝际活性解磷细菌
MPB：山大倪金凤组-白蚁肠道优势厌氧菌的分离与培养
MPB：南农韦中组-植物根际土壤样品的非破坏性连续采集
MPB：西湖大学鞠峰组-微生物群落定量宏基因组和宏转录组
MPB：亚热带生态所谭支良、焦金真等-反刍动物瘤胃样品采集与保存
MPB：新疆生地所李文均团队-盐湖微生物的分离培养及保藏方法
MPB：林科院袁志林组-杨树根系-真菌互作体系构建方法
MPB：扬州大学王梦芝组-反刍动物瘤胃原虫18S rRNA测序分析技术
MPB：邓晔、王尚等-环境样本中的细菌总量测定—流式细胞法
MPB：华南农大王文策组-水禽肠道食糜微生物脂多糖含量的检测
MPB：湖南师大尹佳组-抑菌圈和药敏实验研究益生菌拮抗病原菌和抗生素敏感性的方法
MPB：广东生态土壤所孙蔚旻组-DNA稳定同位素示踪与宏基因组单菌草图组装联用技术
MPB：南农韦中组-根际细菌便利和竞争互作类型和强度的研究方法
MPB：林科院袁志林组-枫香-真菌互作培养体系构建
MPB：张云增、王年等-柑橘根际和根表微生物组样品的收集及核酸提取方法
MPB：林科院袁志林组-栎类外生菌根形态学特征描述
MPB：林科院袁志林组-提取杨树人工林土壤微生物菌体细胞的4种方法
MPB：军科院杨瑞馥、毕玉晶等-培养组学方法优化(视频)
MPB：中科院微生物所蔡磊组-运用可培养组技术开展难培养真菌的分离和鉴定
MPB：中科院城环所苏建强、朱永官等-功能基因高通量定量方法
MPB：中科院微生物所蔡磊组-基于扩增子数据的系统发育树的构建和展示
MPB：中科院生态环境中心邓晔等-细胞内融合基因技术 (epicPCR) 测定功能类群多样性
MPB：中科院生态环境中心邓晔组-环境样本中原核生物的总量测定
MPB：中科院东北地理所王光华组-锁核苷酸PCR解析植物内生细菌多样性方法
MPB：北大口腔陈峰、陈智滨等-口腔常见微生物的培养方法
MPB：南农韦中组-铁载体对根际细菌互作效应的介导作用研究方法
MPB：扬州大学王梦芝组-反刍动物瘤胃原虫样品采集及计数方法
MPB：山大倪金凤组-白蚁肠道木质纤维素降解细菌的分离与培养
MPB：生态环境中心韩丽丽等-土壤病毒组富集及DNA提取
MPB：深大李猛组-基于PacBio SMRT三代测序的红树林沉积物真菌群落的研究
MPB：南农韦中组-根系分泌物调控土壤微生物群落结构和功能的研究方法
MPB：南农韦中组-根际细菌群落资源利用络的研究方法
MPB：南土所冯有智组-基于微量热曲线的微生物群落代谢特征分析
MPB：西湖大学鞠峰组-微生物群落RNA稳定同位素探针技术 (RNA-SIP)
MPB：中国地大侯卫国组- 针对热泉原位培养矿物的低质量DNA提取方法
MPB：林科院袁志林组-野外树木根系取样及根际土收集操作规程
MPB：中农彭静静等-土壤宏转录组样本制备
MPB：山大倪金凤组-黄翅大白蚁肠道放线菌的分离与培养
MPB：中国农科院李玉中组牧草种子内生真菌的分离、鉴定与保存方法
MPB：浙大王谦等-反刍动物消化道微生物CAZymes基因资源的挖掘与功能分析
MPB：上交大王风平组-沉积物、岩石样品总DNA提取
MPB：宁大张德民组-对虾养殖系统微生物组样品的采集与制备
MPB：南土所褚海燕组-土壤宏转录组学样本前处理与数据分析
MPB：微生物所王军组-人类肠道病毒粒子富集及纳米孔测序
MPB：浙大王佳堃组-幼龄反刍动物粪便DNA提取及注意事项
MPB：微生物所蔡磊组-基于二代测序的真菌基因组组装和注释
MPB：浙大王谦组-菌酶一体化重组酵母工程菌的设计与构建
MPB：韩东飞、郝光飞等细菌转录组分析样品制备方法
MPB：南土所褚海燕组-非靶标代谢组测定土壤可提取有机碳组分
MPB：山东农大高峥、周波等-尾菜堆肥微生物组样品取样方法
MPB：华中师大谢波组-微生物非标记定量蛋白质组学样品制备方法
MPB：微生物群落构建过程的空间可视化方法
MPB：猪胃肠道内容物和黏膜样品采集与微生物组成分析
MPB：EGFP荧光标记大肠杆菌的构建
MPB：西湖大学鞠峰组微生物群落胞内胞外吸附胞外游离水环境DNA的分离提取
MPB：中科院深圳先进院戴磊组小鼠粪便样本中短链脂肪酸的定量检测
MPB：基于BIOLOG的微生物群落功能分析
MPB：中科院深圳先进院戴磊组小鼠粪便样本中16S拷贝数的定量检测
MPB：东林牛犇组玉米根系简化细菌群落的定量与其生物防治效果的评价方法(视频)
MPB：浙大王佳堃组瘤胃微生物移植(视频)
MPB：原核微生物群落随机性和确定性装配过程的计算方法
MPB：青岛大学苏晓泉组分享基于分类学和系统发育的宏基因组比较DMS算法
MPB：中科院王光华组土壤和水体环境T4型细菌病毒g23基因多样性研究
MPB：窖泥样品采集与核酸提取
MPB：河湖着生硅藻样品采集、永久玻片制作及鉴定
MPB：上海交大肖湘组分享基于基因芯片的海洋微生物转录组学分析技术
MPB：随机宏基因组测序数据质量控制和去宿主的分析流程和常见问题
微生物组实验手册：中科院、北大和清华等52家单位的74个团队的153篇方法正在创作中
微生物组实验手册计划正式启动、诚邀同行共同打造本领域方法百科全书
实验室管理好助手——Bio-lab

学术告录播、PPT分享

75分钟入门微生物组数据分析和结果解读—刘永鑫(合肥，2021年6月23日)
青年生命科学论坛告：扩增子和宏基因组数据分析与可视化流程—刘永鑫(北京210606)
宏基因组数据分析的机遇与挑战—刘永鑫(北京，2020年12月8日)
刘永鑫：20分钟讲解微生物组数据分析与可视化实战
南京袁军/文涛ISME：基于大数据整合准确预测土壤的枯萎病发生
北生院王金峰Gut：时序微生物组数据重现生物膜装配的动态过程 PPT+视频
西湖大学鞠峰：环境微生物宏基因组学( 告视频+PPT,11月23日)
2020年12月8日中科院刘永鑫告：宏基因组数据分析的机遇与挑战
扩增子和宏基因组数据分析流程和可视化方案—刘永鑫(南京，2020年10月27日)

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USEARCH—最简单易学的扩增子分析流程
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Evolview基础进阶
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会议、专刊、招聘

培训会议

Nature会议：驾驭植物微生物组(21年10月22-24，在线，优惠截止9月24日)
6月4-6日，第三届青年生命科学论坛
6月20-23日，合肥，土壤生物多样性与生物化学过程研讨会
7月23-25日，微生物组-扩增子16S分析第12期
7月30-8月1日，高级转录组分析和R语言数据可视化第12期
8月20-22日，微生物组-宏基因组分析
上传数据，直接分析，这才是真正的生物云

专刊征稿

mSystems和Microbiology Spectrum杂志“肠道微生态专题”论文征稿
Medicine in Microecology：医学微生态中的大数据专刊征稿(宁康、苏晓泉)
Medicine in Microecology：母婴微生物组专刊征稿(陈廷涛、王金锋)
JOVE征稿：植物微生物组学方法专刊(牛犇、韦中、高峥、王蒙岑)
SEL专题征稿：Microplastics in agroecosystems
JoVE微生物组专刊征稿，写方法拍视频教程发SCI
《微生物学》“微生物大数据资源”专刊邀稿函
生物工程学 -微生物组测序与分析专刊
生物工程学 -“微生物与生命健康”专刊征稿通知

人才招聘

芬兰阿尔托大学人工智能实验室程路组博士生招聘-肠道菌群进化与人类疾病等方向
华南师范大学生命科学学院汪肖云教授团队招聘青年英才和博士后
南京医科大学陈连民组招收博硕士研究生(肠道微生物与心血管代谢健康方向)
香港中文大学Center for Gut Microbiota Research招聘启事
中山大学左涛组(IF>10的文章15篇)博士后招聘年薪35万
中山大学附属第一医院精准医学研究院魏泓组招聘启事
中国科学院武汉植物园环境基因组学杨玉义组招聘科研人员
福建农林大学朱方捷组招聘讲师/副教授/助理——生信分析方向
加州大学河滨分校门玉洁课题组招收博士生两名——环境微生物方向
南方科技大学宋毅课题组招聘启事
南科大海洋系侯圣伟组博后招聘(视频)
中农王金锋组诚聘微生物组学方向博士后
The Innovation: 青年编委招募
中科院城环所朱永官组博后招聘
纽约伊坎医学院房刚组诚聘博士后: 表观基因组, 宏基因组, 精准医疗
华岩资本—微生物领域项目投递通道
北京大学吴华君课题组多组学数据分析方向博士后和技术员招聘启示
国内三代测序头部企业-武汉希望组生物科技有限公司急招
中科院昆明植物所李爱荣组诚聘博士后—根部半寄生植物的根际过程及调控机理
深圳先进院赵国屏课题组2021年博士后招聘启事
曹晓风研究组诚邀国内外优秀青年人才加盟
北京大学北京天然气水合物国际研究中心招聘生信博后
中科院动物所王关红组昆虫微生物组学招聘助研、博后和助理
金龙鱼母公司(新加坡丰益国际)院士团队招聘宏基因组数据分析科学家
香港中文大学Center for Gut Microbiota Research招聘启事
中国农大-瓦大国际合作微生物组方向博士生项目
金秋十月正当时，未知君招人啦！
予果招募令
中科院微生物所高程组招聘助研3名(正式编制)
农科院环发所张西美课组招聘博后和科研助手(土壤微生物生态学)
中国医学科学院王辰院士组招宏基因组方向博后40万/年
南方科技大学Medi-X研究院-环境健康平台博士后招聘
南京农大王保战组环境微生物招聘博后
中山大学丁涛组博后及副研招聘-微生物组学方向
中科院微生物所高程组博士后招聘-真菌组与生态功能的研究
北京大学口腔医学院陈峰课题组微生物方向招聘博士后
西湖大学郑钜圣组招聘博士后-人类肠道微生物、多组学整合、生物信息交叉学科方向
中科院北京生科院赵方庆团队招聘人体微生物组方向特别研究助理
浙大蒋超组招聘博后和技术员：环境暴露组和微生物组
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德国波恩大学于鹏组根系与微生物互惠方向招收博士研究生
华中农大津田賢一组招植物微生物组、生物信息方向博士后 2
西湖大学鞠峰团队招聘“土壤微生物组学”与“高通量基因组-培养组学”2名博士后
南科大翟继先组招聘，博士生8万+，博后34万+
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