一、连接服务器

运行环境：Linux服务器

xshell：模拟虚拟终端的Internet和 络程序。 目的是允许计算机充当终端机。

xftp：用于计算机与服务器之间的文件传输。

xshell和xftp下载正版的，不要下载破解版的，官 下载地址：https://www.netsarang.com/zh/xshell-download/

点击“免费授权页面”，输入姓名和邮箱，选择“两者”即可获得正版免费下载链接。

二、软件安装

1、miRanda

适用范围：动物、植物

下载地址：http://www.microrna.org/microrna/getDownloads.do

下载好的压缩文件传到服务器，解压缩：tar zxvf miRanda-aug2010.tar.gz

进入miRanda-3.3a文件：cd miRanda-3.3a/

安装：./configure –prefix=/tools/miRanda

查看安装是否成功：which miranda

出现地址则安装成功。

2、RNA22

适用范围：哺乳动物

下载地址：https://cm.jefferson.edu/rna22/Interactive/

下载完可先在电脑上解压，再将解压后的文件传到服务器使用。

3、TargetScan

适用范围：脊椎动物

下载地址：http://www.targetscan.org/cgi-bin/targetscan/data_download.cgib=vert_50

4、PITA

适用范围：哺乳动物、昆虫

下载地址：https://genie.weizmann.ac.il/pubs/mir07/64bit_exe_pita_prediction.tar.gz

下载好的压缩文件传到服务器，解压缩：tar -zxvf 64bit_exe_pita_prediction.tar.gz

make安装：make install