本人自己的一个小课题需要分子对接,这里在做的时候顺便写一下教程。
AutoDock 站下载地址:http://autodock.scripps.edu/
进入 站首页点击downloads,进入下载页面,需要从这里下载2个软件,AutoDock 4.2和mgltools。
AutoDock 4.2的下载:右键proceed to download page,在新窗口中打开。在打开页面底部有下载地址,根据自己的系统选择下载,这里是Windows。懒人链接:
http://autodock.scripps.edu/downloads/autodock-registration/autodock-4-2-download-page/
其他分子对接辅助软件,比如:OpenBabel,PyMOL,Python等软件自己Google下载,Python需要安装2.0序列的,这个必须安装,安装完成后需要配置环境变量,不知道怎么配置环境变量,Google或者百度一下,很简单,我记得在我TCGA差异分析的视频教程文章中【一文就会TCGA数据库基因表达差异分析】介绍TCGA官方工具下载数据的时候有介绍,如果不是这研究方向的,没必要去看这个视频,百度来的快些。当然,这些安装包我上传到了云盘。
链接:https://pan.baidu.com/s/1oLKITNG-mRWBVOSXepbJrg ,提取码:mx5u
同样的,安装mgltools软件的安装目录下有个adt.bat,我这里的安装路径是:C:Program Files (x86)MGLTools-1.5.6,将adt.bat这个文件复制到F:Autodock文件中。
然后我们打开Autodock软件。点击File,选择Preferences,再选择Set。

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