linux可变剪切分析,生信实操|一个生信素人的上道经验分享-转录组测序(可变剪接篇)…

原标题:生信实操|一个生信素人的上道经验分享-转录组测序(可变剪接篇)

安装成功:

生成模型文件为classifiers.zip。

2. 过滤比对结果文件

本步主要使用步骤一生成的模型文件和比对文件,格式为SAM文件。若待分析物种为常见物种,则可在SpliceGrapher软件classifiers文件中自带的模型文件。使用sam_filter.py过滤比对结果。

预测单基因可变剪接时,生成的结果文件为*.gff。生成文件内容如下:

生成结果图片如下:

b3cdc1e8a1016546a966f98c88b575f2.png

经验总结

文章知识点与官方知识档案匹配,可进一步学习相关知识CS入门技能树Linux入门初识Linux24755 人正在系统学习中 相关资源:免费的linux作软件SecureCRT.zip-其它工具类资源-CSDN文库

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