一个半自动化的spike sorting软件
可用来处理pclamp获得的数据，或者协助clampfit使用

github地址：https://github.com/CongyueZhang/Semiauto-Spike-Sorting

目录

• 必读
• 界面
• 数据的读取
• • 操作
  • 文件命名规则
  • • .abf文件
    • .mat文件
• 自动处理过程
• 手动调整过程
• • 修改
  • 删除
  • 合并
• 附加功能
• 存储
• • Image文件夹
  • Data文件夹

必读

请严格遵守【文件命名规则】，若文件中含有高电平Trigger信 ，请以下划线加上刺激后缀，并保证文件名中仅有一个。

界面

自动处理过程

点击按钮读取数据后，下拉框中会出现已有的通道，选中期望处理的通道后，点击按钮，若该通道的数据从未被处理过，该程序将会对该通道的数据进行自动处理（滤波、峰电位检测、特征提取、聚类）。

1. 首先，找到期望修改的Cluster。例如：图中蓝色峰电位聚类似乎有问题，则可从右上角标签中读取到该聚类为Cluster 1。

2. 在中选中Cluster 1，在中选中，点击按键，此时右侧图像中只显示出选中的Cluster 1。
   

3. 接下来有两个选择：
   ① 点击按键将选中的峰电位添加到新的聚类
   ②点击按键将其添加到中选中的Cluster中（如添加到Unsorted Spikes）

   按下其上任何一个按键后，红色矩形框及其选中的峰电位会在当前图中消失

注：若某一Cluster中所有峰电位都依次被添加到了其他Cluster（即该Cluster中没有了峰电位），则该Cluster会自动被删除。

删除

在中选中期望的删除的Cluster x后，点击，即可将选中的Cluster x删除，里面的峰电位会被归到中。

合并

假设期望合并Cluster a与Cluster b

1. 在中选中Cluster a
2. 执行功能
3. 点击按键，将该聚类中所有峰电位都选中
4. 在中选择Cluster b，然后点击按键

之后，Cluster a中所有峰电位会被添加到Cluster b 中，且Cluster a会自动被删除，即实现了合并功能。

附加功能

附加功能有：

• Mark x in data：会在总信 中，将选中的Cluster x中的峰电位，以其Cluster对应的颜色标出
• Mark all in data：在总信 中，以红色标出所有的峰电位。
• View(only) x in data：在记录时间中，只显示出Cluster x（可多选），而不显示噪声与其他峰电位。
• x’s frequency：显示出Cluster x的放电频率（Cluster x可多选）
• all’s frequency：显示出峰电位的总放电频率

存储

处理文件时，该软件会自动在数据路径中新建文件夹

Image文件夹

文件夹中含有（多个）通道文件夹。处理过程中，生成的各种功能图片会自动保存到对应通道的路径，且覆盖以往同名称的图片。（例如，前后执行过两次观看Cluster 5放电频率的功能图，那么，只有后一次的功能图会被保存下来）

Data文件夹

在处理结束，软件关闭的时候，会自动将本次处理后的数据，保存在Data文件夹中。此后可直接Load此data.mat文件进行查看与处理。处理后会以相同的方式在该路径下生成新的Result等文件夹。