最后更新：2018.3.21
(多图预警)
今年7月开始用Ubuntu，现在已经3个月了(P.S. 这句话是 2016 年写的，其实现在已经一年半了)。目前基本上windows里常用的所有软件都找到了Linux的替代品。
每个人用电脑的目的不一样，需要的软件也不一样。以下是只是我个人认为不错的软件。
我的系统语言设置成了英文，所以软件显示的都是英文，不过这些软件大部分应该是支持中文的。
另外以下“开源”仅表示可以获得源代码，不代表严格意义上的开源。
P.S. 最近从原版 Ubuntu 换成了 Ubuntu Gnome，感觉界面风格看上去比原版的好看多了，尤其是深色主题。强烈推荐大家试一试 Ubuntu Gnome。而且升级到 17.10 以后，虽然会被并回原版的分支，但是原来的 Ubuntu Gnome 配色(蓝色)依然会保留，不会变回原版的配色(橙色)。
=============常用工具篇=============
输入法：搜狗拼音输入法
图略
办公软件：WPS Office
不开源。
优点：相比 LibreOffice 界面更加现代一些；支持 doc、ppt、xls、docx、pptx 和 xlsx。
浏览器：火狐(Firefox)
事务管理工具：Evolution
图片查看器：gThumb
开源。
缺点：对高分辨率屏幕的支持不好，显示的时候有马赛克。
非官方百度 盘客户端：bCloud
开源。和 页版一样会受到百度的限速，不过速度略快一些，而且支持点断续传。
我运行 setup.py 的时候提示出错，于是就直接用 python3 运行里面的 bcloud-gui 了。第一次运行出现错误，提示没有某个包，用 pip 安装这个包即可。
即时通讯工具：Wine QQ International
(该软件已被腾讯封杀，所以移动到了回答的尾部。)
电子词典：星际译王(StarDict)
开源。词典内容需单独下载。支持模糊查询，光标取词。
优点：预览实时更新、同步滚动。
缺点：有时预览和原文的滚动会错位；没有搜索功能(写完速查表之后可以导出 html，然后在 Chrome 里搜索)。
优点：界面美观；运行相对稳定；大量的调色工具。
缺点：只有最基本的转场特效和文字特效，因此只适合调色或简单的剪辑。
图片处理软件：GIMP
开源。功能上相当于精简版的 Photo Shop(但是不支持.ps格式)，简单的修图调色够用了。
建议打开 Single Window Mode(单窗口模式)。否则默认的是每个工具栏都是一个单独的窗口，用起来比较麻烦。
矢量图制作软件：Inkscape
开源。非常好用的矢量绘图工具。曾经用它设计过一张封面，也用来做过展板。
开源。支持简单的代码补全。
优点：轻量级应用，打开迅速；界面美观。
缺点：代码补全不会根据语法来排除不可能的选项，所有出现过的 token 都会成为选项。
一个小巧而强大的工具。比较适合 C/C++ 的开发。
优点：支持完整的代码补全、调试功能。
缺点：高级功能(一键编译、连接调试器)的学习曲线陡峭。
音频控制软件：PulseAudio Volume Control
Ubuntu 不是自带音量管理器嘛，为啥还要装额外的软件实，这个软件的主要功能只是控制音量，不过它还有很多高级的玩法，比如能分别控制每个软件的录音、播放音量，还能重定向音频流。当我们想內录扬声器的声音时，可以直接把录音软件的输入流改为扬声器的输出，这样就不用通过麦克风来翻录了。
P.S. 部分功能已经在 Ubuntu 17.10 的设置界面里提供，但是这个软件的功能还是更多一些。
远程桌面连接工具：Team Viewer
闭源。个人用户免费，不能用于商业用途。可以用其他电脑甚至手机远程操作这台电脑。可以在没有互联 的情况下用局域 建立连接。
分区工具：GParted
可以进行磁盘分区的格式化、移动、扩容等。
缺点：对 NTFS 的支持不完善。
注意：操作需谨慎！一定要记得备份！
Minecraft
闭源。付费游戏。感觉大家应该都知道这个游戏，不用多解释了。
Steam
里面支持 Linux 的游戏还是挺多的。用 .deb 安装可能出现启动后没反应的情况，这个页面的评论中有解决方法：[Steam] mesa broken with libgcrypt 1.7
安装方法：
在 winecfg 里添加以下替换：
===========以下是原回答中对 Wine QQ 的描述===========
使用 Wine 将 QQ 2012 移植到了 Linux 上。我最近不怎么用 QQ，只是看评论抱怨不能用 QQ，于是刚刚下载下来测试了一下。安装之后需要重启一下系统才能让 QQ 的图标出现在状态栏上。登录的时候，密码框不会显示点，而是乱码，不过不影响登录。基本的聊天功能可以使用，字体正常，表情也可以使用。查找账户功能正常。消息提示正常。目前发现的BUG有：无法加载群动态，无法加载群文件，截图后需要粘贴一下图片才能出现，只要不操作QQ即使仍在操作电脑也会被认为离开，鼠标悬停在头像时弹出的提示框只显示昵称和 QQ 。另外版本太低，无法使用文件传输助手(如果只想传照片的话，可以加自己为好友哦)。
据说还有一个 Wine QQ 2013，但是 BUG 更多。
=============11月17日更新=============
添加了三个软件和两个游戏。
对软件进行了分类。
修改了一些描述。
=============11月18日更新=============
添加了 Wine QQ， Geany 的 Debugger 插件和 CS。
修改了一些描述。
=============12月3日更新=============
添加了炉石传说
=============12月6日更新=============
添加了 WPS Office
=============12月20日更新=============
添加了 RecordMyDesktop
另外为什么赞数只有收藏数的一半啊……
=============12月28日更新=============
添加了 bCloud， ffmpeg 和 Transmission BitTorrent Client。
=============12月31日更新=============
添加了 gpointing-device-settings(今天突然想到之前更新的时候总是忘了加这个……)
=============17年2月24日更新=============
添加了 Sublime Text。
Wine QQ 失效， 移动到了文章的末尾。
=============18 年 1 月 7 日更新=============
添加了 Atom, PyCharm 和 VS Code。
添加了 Foxit Reader 和 gThumb。
因为篇幅原因，删除了 Sublime Text 和 Geany。
=============18 年 2 月 8 日更新=============
添加了 Evolution、Remarkable、tlp 和 indicator-cpufreq。
更新了部分软件的使用感想和最新版本截图。
=============18 年 3 月 21 日更新=============
添加了 Darktable
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