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曼哈顿图，学名 Manhattan plot，是全基因组关联分析的标配，可以展示所有染色体上的不同位置的 SNP 的显著水平，因酷似曼哈顿的海边景色（高楼林立的）所以称为曼哈顿图。

本质上，曼哈顿图是以 SNP 在基因组上的坐标/位置为 X 轴，以显著水平（通常是-log(P)）为 Y 轴的散点图，所以理论上说所有能做散点图的工具都能画曼哈顿图。

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