聊一聊:基因功能通路分析的一款明星软件DAVID

1

打开DAVID主页, 址 https://david.ncifcrf.gov/,显示界面如下,选择并点击Start Analysis

2

选择自己想要分析的基因复制在对话框内,按照如下步骤:1.List1:在A处粘贴基因名称或者在B处提交基因名单文件。2.选择基因名称类型,一般选择基因的官方名称OFFICIAL GENE SYMBOL3.选择gene list 4 点击Submist list提交基因列表

3

提交完成后, 页会弹出如下提示框,点击确定。

4

页出现以下界面时,按如下步骤进行操作:1.点击1 list12 .选择Use3.选择物种 人类4 .点击Select Species5.点击右侧Functional Annotation Chart

5

点击结束后,会出现以下界面,为了使输出结果简单明了,首先可以选择清空默认选项,在Check Defaults处取消勾选。

6

Gene Ontology可分为分子功能,生物过程和细胞组成三个部分。根据自己的实际情况,可以选择Gene_Ontology下的GOTERM_BP_DIRECT(生物过程分析)和Pathways 下的KEGG_PATHWAY(信 通路分析)。选择完成后,点击 Functional Annotation Table。

7

以下是点击Pathways 下的KEGG_PATHWAY后输出结果。

声明:本站部分文章及图片源自用户投稿,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!

上一篇 2017年6月24日
下一篇 2017年6月25日

相关推荐