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打开DAVID主页, 址 https://david.ncifcrf.gov/,显示界面如下,选择并点击Start Analysis。
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选择自己想要分析的基因复制在对话框内,按照如下步骤:1.List1:在A处粘贴基因名称或者在B处提交基因名单文件。2.选择基因名称类型,一般选择基因的官方名称OFFICIAL GENE SYMBOL。3.选择gene list 。4 点击Submist list提交基因列表。
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提交完成后, 页会弹出如下提示框,点击确定。
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页出现以下界面时,按如下步骤进行操作:1.点击1 list1。2 .选择Use。3.选择物种 “人类”。4 .点击Select Species。5.点击右侧Functional Annotation Chart。
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点击结束后,会出现以下界面,为了使输出结果简单明了,首先可以选择清空默认选项,在Check Defaults处取消勾选。
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Gene Ontology可分为分子功能,生物过程和细胞组成三个部分。根据自己的实际情况,可以选择Gene_Ontology下的GOTERM_BP_DIRECT(生物过程分析)和Pathways 下的KEGG_PATHWAY(信 通路分析)。选择完成后,点击 Functional Annotation Table。
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以下是点击Pathways 下的KEGG_PATHWAY后输出结果。
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