一款超级简单的热图绘制软件—HemI

关于HemI

二代测序中常常用到热图分析，但往往基于R语言或者别的生信方法完成，为了绘制个热图专门去学习个语言呢又心有余而力不足，因此今天介绍一款超级简单的软件——HemI软件，与其他软件相比，它界面化的操作只需要点点鼠标就能完成，即使不会生信也可以自己绘制高大上的热图啦。

1、 软件安装

1）HemI 1.0使用java实现，可以支持包括OS X，Windows，Linux在内的操作系统，本地独立安装包可于http://hemi.biocuckoo.org/down.php下载。选择合适的安装包进行下载，下载后双击安装包进行安装，如果出现安全提示点击允许运行。开始安装后根据提示进行安装。Windows下的安装过程如图所示：

2）点击next，选择安装路径

3）一路next，直到最后，点击finish完成安装

2、 HemI使用

1） 加载数据，点击file->load来加载数据（该软件支持4种格式文件：Excel工作簿（97-2003，*xls），逗 分隔的文件（*csv），制表符分隔文（*txt），Heml工程文件（*.xml））

如果是选择的Excel格式来加载文件，则需要选择需要的表单作为数据源（如果您选择的工作簿包含多个表单）

2）选择数据，数据加载后会弹出数据加载器，选择需要创建的数据，可根据对话框顶部的“Tip”来选择需要展示的数据，或者点击“Auto select”让程序自动选择，选择好之后点击finish。选择数据对话框其他参数如下图所示：

3）参数设置。选择好数据之后点击finish。热图展示及主面板参数选项如下图所示，每次设置后点击右侧的refresh按钮重置图形

4）图形输出。File->export image，按预定格式和分辨率输出图片即可。

5）更多HemI特性。右击热图将会弹出以下对话框，按需求进行设置即可。

以上就是该软件的全部内容。

供稿：曾丽云