北京师范大学贺永教授团队研发的另一款新软件

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今天，我们将继续推荐由该实验室研发的另一款具有重要国际影响力的神经影像脑连接组可视化软件——BrainNet Viewer。

研究者们在进行多模态神经影像和复杂脑 络计算分析之后，常常会面临一个重要的难题，即研究结果的可视化。如何对神经影像和脑 络分析结果进行准确、美观、快速、简便的展现，是将研究成果清晰并明确传达给读者的重要途径。然而，国际上适用于神经影像和脑 络的可视化方法和应用软件十分匮乏。

针对这些问题，北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室夏明睿、贺永等，发展了适用于神经影像和脑 络的三维可视化方法，研发了具有自主知识产权的神经影像和脑 络的可视化软件——BrainNet Viewer (Xia et al. 2013)（图1），并发布在著名的神经影像工具 站NITRC上供用户免费下载：http://www.nitrc.org/projects/bnv/。

图1：BrainNet Viewer软件主界面

BrainNet Viewer的主要特点有：

1. 基于MATLAB、具有图形界面的跨操作平台（如Windows, Linux等）的开源软件包；

2. 支持跨物种（人、猴、鼠等）的神经影像和脑 络数据的可视化（图2）；

3. 支持多模态（结构磁共振、扩散磁共振、功能磁共振、脑电图/脑磁图/近红外等）神经影像和脑 络连接模式的可视化（图2）；

图2：BrainNet Viewer支持多物种、多模态神经影像和脑 络的可视化

4. 提供了多种常用的脑 络节点定义模板（如AAL、Harvard-Oxford等结构模板；Power264、Dosenbach160等功能模板），并支持用户生成自定义的脑节点模板；

5. 提供了丰富、灵活、易用的配置面板用于调整脑 络节点和连接的大小、颜色、透明度，来突出脑 络的拓扑特征（图3）；

图3：丰富的参数设置面板

6. 支持将断层数据通过曲面投射和三维渲染映射到三维脑曲面模型上，从立体的角度提供更精准的皮层定位（图4）；

图4：BrainNet Viewer的脑曲面映射可视化

7. 支持将神经影像和脑 络元素以多种不同的形式进行组合展现（图5）；

图5：BrainNet Viewer支持的脑 络图模式

8. 支持以高清分辨率导出图像为常用图片文件格式，支持生成脑 络的旋转动画，供研究者在文章和演讲中使用。

BrainNet Viewer已经在国际神经影像和脑 络研究领域产生了重要的影响:

1. 在NITRC 站的下载量达到18000余次；

2. 已被哈佛大学、牛津大学、耶鲁大学、剑桥大学、斯坦福大学、麻省理工大学、北京大学、清华大学、中科院等600余个国内外脑科学研究实验室采用（图6）；

图6：

BrainNet Viewer用户的全球分布图

3. 已被700余篇英文论文采用，包括发表在Nat Rev Neurosci、Trends Cogn Sci、Neuron、PNAS、Brain、Mol Psychiatry、Biol Psychiatry等国际顶尖杂志上的工作；

4. 至少18幅采用BrainNet Viewer绘制的文章插图被选为当期杂志的封面，包括Biol Psychiatry、Ann Neurology、Cereb Cortex、Neurology等国际主流杂志（图7）；

图7：

5. 大约每3天就有一篇采用BrainNet Viewer的英文文章发表；

6. 论文发表在PLoS ONE，为ESI前1%高被引论文，入选该杂志十周年10大高被引论文

http://collections.plos.org/10yr-highly-cited。

BrainNet Viewer软件作为我国具有自主知识产权的神经影像和脑连接组可视化公用平台，已被广泛应用于全球脑认知和脑医学领域，引领了脑 络可视化技术的发展，为研究者提供了极大便利，也为推动该领域的快速发展做出了重要贡献。

如果您在研究工作中使用了BrainNet Viewer软件，请引用该软件和相关论文。

参考文献：

BrainNet Viewer Toolbox: http://www.nitrc.org/projects/bnv/.

Xia M, Wang J, He Y (2013) BrainNet Viewer: A Network Visualization Tool for Human Brain Connectomics. PLoS ONE 8(7): e68910.

贺永教授团队

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