#软件工程##基因组观#Juicebox:可视化Hi-C互作区(Cell System 干货)中英对译V1.1

Juicebox Provides a Visualization System for Hi-C Contact Maps with Unlimited Zoom

Juicebox程序 提供了Hi-C互作图谱高分辨率的可视化方案

Erez Lieberman Aiden(大神级的人物,诺奖都无法企及)

The Center for Genome Architecture, Baylor College of Medicine, Houston, TX 77030, USA

?Juicebox enables users to explore Hi-C contact maps

?Juicebox程序允许用户探索HiC DNA互作图谱

?Users can create maps from their own experimental data

?用户可以以自己的实验数据 来创建图谱

?Users can zoom in and out of a contact map in real time

?用户可以实时放大缩小图谱 并寻找联系

?Maps can be compared to 1D tracks, 2D feature sets, or one another

?图谱可以解构为“一维”,“二维”特性集,相互之间进行转换

Hi-C experiments study how genomes fold in 3D, generating contact maps containing features as small as 20 bp and as large as 200 Mb.

Hi-C 实验研究 基因组如何折叠三维形态;生成的DNA接触图谱精度能小到20 bp和长到200 Mb DNA的互作。

Here we introduce Juicebox, a tool for exploring Hi-C and other contact map data.

本工作介绍Juicebox程序,探索Hi-C 的工具和其他图谱数据之间的联系。

Juicebox allows users to zoom in and out of Hi-C maps interactively, just as a user of Google Earth might zoom in and out of a geographic map.

Juicebox程序 允许用户放大和缩小Hi-C 图的交互图谱;就像用户使用谷歌地球 放大和缩小地理地图的体验一样

Maps can be compared to one another, or to 1D tracks or 2D feature sets.

图谱可以比较:或“一维”轨道或“二维”特性集。

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