科研常用的数据库及软件

在日常的临床工作和科研当中，大家可能会遇到一些问题，遇到问题之后可能首先会查阅文献，查阅文献之前，可能会问一下自己，这篇文献来自于哪里？目前所有纳入这些文献的数据库都有哪些？怎么样去找到这篇文献？

01

如何全面检索国内外医学文献

国外常用数据库检索平台：

Pubmed

Embase

Sci

Google Scholar

1、Pub Med

Pub Med由美国国立医学图书馆(NLM)下属的美国国立生物技术信息中心 （NCBI ）开发研制的一个 络检索系统。主要提供基于WEB的MEDLINE数据库检索服务。目前世界上最权威的生物医学数据库，而且是免费的。PubMed 并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者（付费或免费）的链接。

址：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/

上图是Pubmed的主体的官 页面

Pub Med 基本检索

基本检索首先是全文的检索，只要全文当中出现了这关键词的文章，都会检索出来，所以它的检索范围非常广泛。

最左边这一栏是对检测结果进行筛选，比如说按照文章发表的时间和文章类型筛选，右侧包括文献展示的方式，检索出来的结果是以摘要还是以全文的形式展现出来。此外，还可以将检索出来的结果批量下载，下载完以后，可以把这些文件导入自己的文献管理软件里面进行文献的管理。

Pub Med 高级检索

Pubmed还可以提供完整的检索式。在做meta分析的时候，需要提供一套完整的检索式。Pubmed提供完整的检索式方案，可以在文章中引用。

Pub Med 下载全文

当在Pub Med上检索出文章之后，平台会给提供原文的链接，这样就可以下载了。

2、Embase

Embase是荷兰医学文摘数据库，仅次于pubmed的一个医学数据库，收藏内容偏重于药学文献。内容为将 EMBASE 和 MEDLINE两大数据库整合并从 MEDLINE中去掉重复的记录。

Embase 检索界面

上图为Embase主界面

上图为Embase快速检索结果

Embase包括基本的检索和高级的检索。目前国内很多高校已经停订该数据库，但也可以从Ovid检索平台去检索数据库文献

Ovid数据库平台 址：https://ovidsp.dc2.ovid.com/ovid-a/ovidweb.cgi

3、SCI 数据库

美国《科学引文索引》（Science Citation Index, 简称 SCI ）。1957 年由美国科学信息研究所（Institute for Scientific Information, 简称 ISI）在美国费城创办，是由美国科学信息研究所（ISI）1961 年创办出版的引文数据库。

数据库平台：Web of Science

同PubMed、Embase相比，范围更广

SCI 数据库检索平台

上图为SCI检索平台主界面

上图为SCI检索平台快速检索结果

Web of Science 基本操作

与前面两个检索平台不同，Web of Science的独特之处就是可以提供文章被引用的次数。

Web of Science还可以对文章的参考文献进行溯源，例如点开一篇文献后，下面会提供很多参考文献，每一篇参考文献都可以对其进行筛选，进行再查阅。此外，还可以把检索出来的结果进行整合下载，并使用文献管理软件进行管理。

WOS查询杂志信息

Web of Science还能够提供一些杂志的具体信息，比如要查询某一个杂志是哪个国家的？每年要发行多少刊？影响因子是多少？都可以通过这个 站进行查询。

Web of Science还可以进行Thomson Reuters JCR分区查询（汤森路透JCR分区；JCR，journal citation reports, 期刊引证 告），JCR分区按每个学科上一年影响因子降序排列进行四等分，并划分分四区。

查询方式：Web of Science 站

点击菜单栏 “Journal Citation Reports”，输入期刊名称查询，可获取非常丰富的期刊引证数据。

例如，要找STROKE这个杂志，可以看到它的影响因子是7.9分. 这里可以给大家简单地介绍下影响因子的计算方法。

上面的图就是杂志的影响因子和去掉了自引之后的影响因子的计算方法。比如说查询2021年这个杂志的影响因子，计算方法是根据2019年和2018年该杂志发表的文章被引用的次数，除以2019年和2018年发表文章的数量，即是这个杂志的影响因子。

如Stroke杂志，在2018年和2019年发表的文章被引用的次数8,033次，这两年杂志共发表了1,015篇文章，两者相除就得到了该杂志在2020年的影响因素为7.914分。

Google Scholar

Google 推出的一个针对的学术的搜索引擎，作为外文文献的辅助搜索工具。但由于受到 络的限制，推荐使用 谷歌学术镜像登录。

址：http://scholar.google.com/

Google Scholar 基本检索

如果在文章的右侧提供pdf的标识，点进去之后，就可以直接下载这篇文献。

除了上面介绍的四个 站以外，再给大家推荐一下其他的 站：

Cochrane 协作

Cochrane 协作 是国际非营利组织，成立于1993年，通过广泛的协作，以科学的方法制作、保存、传播和更新临床医学各专业领域的系统评价，为临床实践和医疗卫生决策提供最佳的科学证据。

上图是临床证据等级表，最高等级的临床证据就是系统回顾和meta分析。Cochrane系统综述可以对既往的临床证据进行汇总，可以为很多临床指南提供证据。

Cochrane Library主要包括7个独立数据库

值得关注的是：系统回顾Cochrane Database of Systematic Reviews 这个数据库，收录了由Cochrane协作 51个系统评价专业组在统一工作手册指导下完成的系统评价。

CDSR 包括两种文档：

Cochrane系统评价全文库（completed reviews）

Cochrane 研究方案（protocols）

比如与我们最相关的卒中专业组，对所有关注的关于卒中的问题进行统一汇总分析，进行收集整理最后把结果发到这个数据库上。这种数据库主要包含了两种文章形式，首先研究方案（protocol），注册了Cochrane 题目之后，先发表一篇关于这个研究的方案，然后，再对这个研究进行做系统回顾和meta分析，最后发表一篇正式的综述。

本团队去年也成功注册了多个Cochrane题目，包括颅内动脉狭窄、烟雾病、急性卒中和椎动脉狭窄等疾病相关的治疗方式。

其他 站推荐：

GeenMedical也是常用的 站，可以对文献进行检索，下载。

GeenMedical 检索功能

除了检索文献，还可以提供杂志的影响因子以及分区，并提供全文下载的链接。

GeenMedical 其它查询功能

1、国自然项目查询

申 课题之前，可以在这里查询国自然课题的申 情况。例如，输入颈动脉狭窄，就可以查阅既往的关于颈动脉狭窄相关国自然课题申 情况。

2、杂志信息查询

也可以查询杂志的一些信息。

Pubmed汉化版

这个 站也可以快速查找一些文献，和其他的一些检索平台不同，当注册完， 站会把查询到原文pdf版本直接发送至邮箱，而且速度较快。

国内核心期刊

北大核心：北京大学图书馆“中文核心期刊” ，北大核心期刊每四年由北大图书馆评定一次，并出版《北大核心期刊目录要览》一书。

统计源期刊：

如何找到一篇中文文献？

查找中文文献：知 、万方、维普等，由于版权的限制，这些 站在校内或者院内使用会比较方便。检索方式也是可以通过主题词与关键词进行结合的方式进行检索。

用于检索中英文文献的 站：

大木虫学术导航： 址：4243.net/

没有下载次数限制，中外文献全站免费，备用入口较多，入口稳定。

直接检索：

期刊内检索

02

常用的软件 – ENDNOTE

Endnote是一款被广泛使用的文献管理软件，其是SCI（Thomson Scientific 公司）的官方软件，支持国际期刊的参考文献格式有3776 种【也可以自定义期刊引用格式】。软件非常方便进行 文献整理，笔记，备注，分类，导出期刊格式，进行数据迁移等。

如何使用Endnote:

1、新建数据库

第一次打开Endnote需要建立一个文献数据库，相当于一个属于自己的图书馆，用来存放文献。

点击File-New，会弹出框，这里提醒要建立的文章库的名称和保存位置。

保存之后会出现2个文件，第一个是库存，相当于文献原文件，第二个是目录，相当于一份文献清单。

点击完之后它可以自动生成需要的库

分类区：可以对文献进行细致化管理和分类，方便文章写作。

文献信息区：会提供一些文献的基本信息。

2、文献导入：

导入文献操作 1：

英文文献：Pubmed下载到文献的引用文件（文件后缀.nbib）, 直接点开即可导入

从pubmed下载一篇文献之后，可以点击send to的按键，选择最下面的文件格式，下载文件，随后点击打开文件，该文献便可直接导入至Endnote软件中去。

谷歌学术上同样也是这样的操作。

导入文献操作2：

中文文献：知 导出文献信息 TXT文件即可

中文文献也可以进行导入，例如在知 上找到文章以后，会有endnote文件形式，然后选择下载，下载完成后生成TXT文件,然后把这个文件可以直接导入。

导入文献操作 3：

从文献数据库下载的文献pdf格式导入

如果已经有下载好的PDF格式的文章，可以通过Import导入的方式把文献导入到Endnote的软件中。

3、文献分组

对文献进行分组管理

可以根据自己的写作思路对文献进行分组管理，提高写作效率。

4、文献笔记

导入文献笔记：针对某个文献可以建立自己的笔记

两种方式：

1、创建单独Word文件（TXT文件同样也可以），直接拖动到文献信息区【Reference】的【File Attachments】即可

2、直接记录在【Note】或者【Research Notes】板块

张潇

首都医科大学宣武医神经外科

博士研究生在读

学习经历：首都医科大学博士在读，导师焦力群教授;2022年获批国家公派留学资格，前往牛津大学联合培养

研究方向：缺血性脑血管病的临床及基础研究

宣武脑血运重建CRC

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