现如今，随着癌症研究的不断深入，以及测序的持续高温，TCGA在科研界中保持极高的曝光率。大量的科研人员利用TCGA数据库来帮助自己寻找感兴趣的靶点，或是对自己的科研成果进行验证。今天，小编给大家带来一个TCGA数据库的第三方online tools，叫做“LinkedOmics”，帮助大家更加方便的使用TCGA数据库。（http://www.linkedomics.org/login.php）
1. 这个 站需要大家先去注册，但是注册非常的便捷，使用自己的邮箱即可。
2. 直接选择所要研究的癌症类型（共有38种癌症），这里以甲状腺癌为例（Thyroid carcinoma）
4. 这一步是Optional的，是对样本的进一步筛选；
5. 这一步在输入框中写上基因名字；
6. 此处因为小编想看H19这个lncRNA的生存分析等结果，所以选择clincial的选项，统计方法选择非参数检验(Nonparametric tests)；
7. 如果大家是想去看和H19存在共表达的基因，或是查找被H19调控的miRNA的correlation，可以根据自己的需求，在上一步选择对应的数据类型；
8. 点击递交后，页面会生成你所感兴趣的基因的分析结果
然后点击view，就会生成你所感兴趣的图。比如生存分析如下图所示：
这 站极其方便易学，不用我们去TCGA中费力的查找具体信息，希望可以帮助到大家，为你们的研究也带来便利。
转自生信草堂
声明：本站部分文章及图片源自用户投稿，如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢！