还在为基因序列对比分析发愁吗？这两款软件让你的科研事半功倍

在进行基因分析的实验室中，经常需要进行序列比对（sequence alignment)，通常情况下我们会选择使用NCBI上的BLAST工具，但在实际工作中，BLAST序列比较有一些缺点，如对比分析速度慢，比对结果不直观、难以处理，比对不能显示基因内含子及其基因定位等。今天小编给大家两款安利这两个常用 站，帮助你轻松处理基因序列。

序列处理在线工具包

序列处理在线工具包（The Sequence Manipulation Suite）是一款实用的序列比对分析 站，是DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具的集合。从导航栏可以非常清楚的了解到常用功能：DNA/蛋白质序列过滤器，反序与补序工具，DNA/蛋白质序列分组工具，翻译和蛋白分子量等，下面小编也将一一介绍。

常用功能之：DNA序列过滤器。DNA序列过滤器用来移除非DNA字符。该程序可将序列中的数字与空格去除以使序列更加适用。

常用功能之：限制位点概要工具。使用该工具输入一个DNA序列，可以分析得到该序列限制酶切位点的位置与数量，快速分析确定插入基因片段中是否包含酶切位点。

常用功能之：翻译。该功能主要是将一条DNA序列以指定的读框翻译成蛋白序列。

常用功能之：蛋白分子量。蛋白分子量工具主要用于蛋白序列分子量的预测和计算。

除了以上提到的常用功能，SMS在每一个对应工具处都简略提及了该工具的使用方法和适用情形，对于初涉生物分子领域的小伙伴来说也非常友好。

OligoCalc

第二个给大家介绍的是一款寡核苷酸属性计算器 站——OligoCalc。寡核苷酸是分子生物学常用的实验室试剂之一，DNA寡核苷酸在分子生物学中被广泛用作引物和探针。OligoCalc可帮助用户分析DNA/RN寡核苷酸序列的分子质量、解链温度、溶液浓度、分子间是否互补、等，分析单链和双链RNA和DNA的性质。其使用方法非常简单，将你的引物序列粘贴到对话框中，单击Calculate就能一键计算啦！

除此，点击Check self，即可检测引物之间是否存在互补以及是否可以形成发卡结构。 站还可通过Blast引物序列进而确认引物的特异性：输入序列后，点击Blast，进入Blast 页界面，继续点击View report按钮，即可查询引物所对应的基因名称以及物种。

普健生物依托自主研发的高通量活性蛋白表达系统，噬菌体展示和杂交瘤抗体研发平台，抗体测序、抗体人源化和稳定细胞株构建平台。与各研究机构展开技术服务项目合作，助力IVD检测、疫苗生产、重组抗体开发。