哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所李恒课题组重磅推出三代HiFi宏基因组组装软件——hifiasm-meta。研究论文“Metagenome assembly of high-fidelity long reads with hifiasm-meta”预印本在线发布。
hifiasm-meta是基于hifiasm的宏基因组组装工具:
zymo数据集包含17个物种的21个菌株,包括5个大肠杆菌,每个菌株丰度为8%。hifiasm-meta软件都获得了很好的组装效果(表1)。
综上,hifiasm-meta软件将进一步推动宏基因组组装。hifiasm-meta能够在无需人工干预的情况下,从一个深度测序的样本中组装出更多的环状MAGs。这种高质量的宏基因组组装可能会从根本上改变宏基因组分析,并揭示微生物群落的生物学和生物医学意义。
声明:本站部分文章及图片源自用户投稿,如本站任何资料有侵权请您尽早请联系jinwei@zod.com.cn进行处理,非常感谢!