利用IBS软件画基因mRNA的结构图

IBS(Illustrator for Biological Sequences)是一个简单又强大的绘图软件，它可以几分钟内完成图形的绘制。同时，还拥有多种模板与配色方案，可显著提升绘图效果，从而为我们作图提供了很大的便利。那如何使用IBS进行绘图呢？往下看

第一步：软件安装

进入下载地址 http://ibs.biocuckoo.org/download.php 下载最新版本的软件包，本次操作以windows操作系统为例，下载IBS_1.0.3_windows_20170614.exe ，双击下载好的软件，点击运行，然后选择next，接受协议，next，选择安装位置，基本上就安装好了。

第二步：软件使用

刚开始打开软件的界面如下：

默认的模式是Protein Mode，由于我接下来是要画基因的mRNA的exon结构图，所以选择Nucleotide Mode，点击Enter。

下面是需要画的基因的gff格式(一个基因两个mRNA)

1 ensembl_havana gene 1 5000 . + . ID=gene1;1 ensembl_havana mRNA 1 5000 . + . ID=mRNA1;Parent=gene11 ensembl_havana exon 200 800 . + . ID=exon1;Parent=mRNA11 ensembl_havana exon 1000 2000 . + . ID=exon2;Parent=mRNA11 ensembl_havana exon 2500 3000 . + . ID=exon3;Parent=mRNA11 ensembl_havana exon 4000 4500 . + . ID=exon4;Parent=mRNA11 ensembl_havana mRNA 1 5000 . + . ID=mRNA2;Parent=gene11 ensembl_havana exon 200 1000 . + . ID=exon5;Parent=mRNA21 ensembl_havana exon 2500 3000 . + . ID=exon6;Parent=mRNA21 ensembl_havana exon 4100 4500 . + . ID=exon7;Parent=mRNA2

然后点击下图中的Nucleotide

由于基因长度是5000，所以Start和End设置为1和5000（这样就不需要换算），Height设为1（如下图所示），不然出来的线比较粗，点击OK。

若需要画两个mRNA，选择上步画出来的线，点击右键，选择下图的Duplicate。

画第一个mRNA的第一个外显子exon1(开始位置200，结束位置800) ，选择第一条线，点击右键，选择add中的Domain。在position的Start和End分别输入exon1的起始位置和结束位置（如下图）。

依次画出mRNA1的其他exon和mRNA2的exon，最后的图如下:

还可以给mRNA加名称等文字，点击右键，选择Add中的Note。在Text输入mRNA的ID，点击OK。

如果觉得位置不好，还可以选择移动到合适的位置。

最后保存图片，右键，选择Export Image，保存为PDF格式（如下图），然后填写要保存的文件名即可

以上就是使用这个软件画mRNA结构图的基本操作流程。当然，这个软件还有很多其他功能，这里由于篇幅有限，就只简单分享一下画mRNA的结构图。

再多的操作文档，总是不如实际操作来得理解深刻。所以大家快快动起手来，在实际操作中理解学习，若在学习中有不懂或疑问的地方，您可给我们留言，我们会有专职客服为您服务！